More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3657 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  57.98 
 
 		 725 aa  822    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  52.35 
 
 		 759 aa  680    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  57.87 
 
 		 754 aa  802    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  72.31 
 
 		 744 aa  1086    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  57.22 
 
 		 730 aa  797    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  55.28 
 
 		 736 aa  795    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  54.51 
 
 		 736 aa  782    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  56.1 
 
 		 738 aa  796    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 738 aa  1496    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  61.77 
 
 		 745 aa  909    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  50.34 
 
 		 727 aa  669    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  50.41 
 
 		 730 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  72.45 
 
 		 744 aa  1088    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  56.49 
 
 		 727 aa  813    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  57.84 
 
 		 725 aa  818    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  50.96 
 
 		 730 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  55.42 
 
 		 735 aa  805    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  50.21 
 
 		 733 aa  678    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  48.41 
 
 		 732 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  58.53 
 
 		 725 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  55.62 
 
 		 736 aa  804    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  54.48 
 
 		 734 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  57.73 
 
 		 729 aa  820    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  55.77 
 
 		 735 aa  795    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  73.01 
 
 		 740 aa  1097    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  54.99 
 
 		 738 aa  770    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  50.69 
 
 		 730 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  82.14 
 
 		 734 aa  1246    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  47.43 
 
 		 735 aa  644    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  74.17 
 
 		 726 aa  1071    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  54.83 
 
 		 744 aa  782    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  97.7 
 
 		 738 aa  1472    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  56.23 
 
 		 731 aa  799    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  80.54 
 
 		 739 aa  1207    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  48.91 
 
 		 734 aa  689    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  48.8 
 
 		 733 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  47.84 
 
 		 727 aa  635  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  48.19 
 
 		 722 aa  628  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  47.66 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  46.07 
 
 		 811 aa  616  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  49.17 
 
 		 718 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  41.59 
 
 		 658 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  37.03 
 
 		 709 aa  453  1.0000000000000001e-126  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  40.89 
 
 		 658 aa  449  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  37.43 
 
 		 738 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  30.73 
 
 		 780 aa  422  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  37.43 
 
 		 758 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  41.13 
 
 		 804 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.52 
 
 		 752 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  35.12 
 
 		 720 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  35.12 
 
 		 720 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.39 
 
 		 752 aa  399  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  38.17 
 
 		 724 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.75 
 
 		 801 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  35.33 
 
 		 679 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  35.14 
 
 		 725 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40.82 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  37.65 
 
 		 733 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.84 
 
 		 801 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.84 
 
 		 801 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  33.06 
 
 		 745 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.84 
 
 		 801 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  37.27 
 
 		 744 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  34.78 
 
 		 731 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  35.23 
 
 		 731 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  33.29 
 
 		 730 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  35.23 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  37.04 
 
 		 801 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  35.95 
 
 		 743 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.24 
 
 		 774 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  35.15 
 
 		 731 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  36.83 
 
 		 754 aa  389  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  35.23 
 
 		 731 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  36.55 
 
 		 739 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  34.33 
 
 		 731 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  36.67 
 
 		 739 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  33.56 
 
 		 742 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  43.05 
 
 		 745 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  33.51 
 
 		 731 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  32.74 
 
 		 732 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  42.1 
 
 		 814 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.06 
 
 		 802 aa  382  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  34.47 
 
 		 733 aa  382  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  38.2 
 
 		 662 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  38.2 
 
 		 662 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  41.13 
 
 		 858 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  33.2 
 
 		 734 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  37.69 
 
 		 813 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  36.43 
 
 		 739 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03519  primosome assembly protein PriA  33.83 
 
 		 729 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.822304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  36.52 
 
 		 740 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  34.3 
 
 		 731 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  34.09 
 
 		 736 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  34.69 
 
 		 734 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>