More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1614 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  57.2 
 
 		 740 aa  801    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  59.04 
 
 		 736 aa  836    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  51.6 
 
 		 734 aa  670    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  78.24 
 
 		 725 aa  1107    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  57.18 
 
 		 744 aa  790    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  61.74 
 
 		 727 aa  866    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  78.13 
 
 		 725 aa  1124    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  78.27 
 
 		 725 aa  1120    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  59.06 
 
 		 744 aa  837    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  56.87 
 
 		 736 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  57.18 
 
 		 744 aa  790    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  57.24 
 
 		 738 aa  790    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  51.3 
 
 		 727 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  51.14 
 
 		 745 aa  711    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  51.83 
 
 		 733 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  55.87 
 
 		 734 aa  783    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  56.38 
 
 		 739 aa  770    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  57.51 
 
 		 735 aa  810    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  56.83 
 
 		 734 aa  799    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  57.46 
 
 		 738 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 754 aa  1486    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  57.86 
 
 		 735 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  54.48 
 
 		 731 aa  728    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  56.42 
 
 		 738 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  57.87 
 
 		 738 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  58.98 
 
 		 726 aa  789    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  77.69 
 
 		 729 aa  1094    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  94.38 
 
 		 730 aa  1347    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  57.32 
 
 		 736 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  53.31 
 
 		 759 aa  650    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  51.78 
 
 		 724 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  50.14 
 
 		 732 aa  635  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  50.14 
 
 		 733 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  51.09 
 
 		 730 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  50.55 
 
 		 730 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  51.23 
 
 		 730 aa  621  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  49.46 
 
 		 722 aa  610  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  48.97 
 
 		 735 aa  607  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  48.28 
 
 		 727 aa  603  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  51.97 
 
 		 718 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  44.04 
 
 		 811 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  41.27 
 
 		 658 aa  457  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  40.05 
 
 		 738 aa  455  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  41.97 
 
 		 658 aa  451  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  30.9 
 
 		 780 aa  431  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.96 
 
 		 732 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  33.79 
 
 		 709 aa  419  1e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  38.92 
 
 		 758 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  45.74 
 
 		 858 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  36.42 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  33.47 
 
 		 733 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  38.45 
 
 		 720 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  36.55 
 
 		 739 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.38 
 
 		 732 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  37.4 
 
 		 743 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  39.47 
 
 		 739 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  45.47 
 
 		 752 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  38.45 
 
 		 720 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  40.68 
 
 		 804 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  45.28 
 
 		 752 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  36.54 
 
 		 739 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  37.15 
 
 		 739 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.8 
 
 		 739 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  36.73 
 
 		 746 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  42.05 
 
 		 679 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  36.97 
 
 		 746 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.94 
 
 		 802 aa  395  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.89 
 
 		 739 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.21 
 
 		 745 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.29 
 
 		 802 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.29 
 
 		 802 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  36.64 
 
 		 739 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.21 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  37.57 
 
 		 739 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  40.19 
 
 		 781 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  40.39 
 
 		 803 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  36.93 
 
 		 744 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  33.16 
 
 		 733 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  32.61 
 
 		 730 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40.51 
 
 		 801 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  37.54 
 
 		 815 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.68 
 
 		 801 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  36.79 
 
 		 735 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.56 
 
 		 754 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.21 
 
 		 801 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  38.38 
 
 		 751 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  35.88 
 
 		 801 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  36.35 
 
 		 801 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  36.52 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  36.52 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  36.52 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  37.78 
 
 		 815 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.55 
 
 		 774 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  36.35 
 
 		 801 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  33.38 
 
 		 733 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  45.17 
 
 		 814 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  30.93 
 
 		 749 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.35 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  35.91 
 
 		 744 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  35.71 
 
 		 818 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>