More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0603 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  50.66 
 
 		 744 aa  691    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  53.47 
 
 		 725 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  51.16 
 
 		 736 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  51.73 
 
 		 744 aa  660    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  53.7 
 
 		 730 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  50.95 
 
 		 738 aa  665    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  50.46 
 
 		 740 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  53.57 
 
 		 754 aa  683    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  51.14 
 
 		 736 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  53.72 
 
 		 729 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  50.66 
 
 		 744 aa  692    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  52 
 
 		 811 aa  684    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  52.65 
 
 		 739 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  52.04 
 
 		 727 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  51.56 
 
 		 735 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  50.41 
 
 		 733 aa  672    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  50.61 
 
 		 734 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  52.03 
 
 		 734 aa  704    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  52.57 
 
 		 735 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  50.48 
 
 		 738 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  50.93 
 
 		 736 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  53.5 
 
 		 734 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  52.8 
 
 		 722 aa  675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  52.79 
 
 		 725 aa  704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  52.83 
 
 		 726 aa  692    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  61.04 
 
 		 718 aa  716    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 759 aa  1493    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  52.49 
 
 		 738 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  49.12 
 
 		 727 aa  658    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  52.35 
 
 		 738 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  52.93 
 
 		 725 aa  703    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  54.56 
 
 		 731 aa  743    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  50.54 
 
 		 724 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  47.22 
 
 		 745 aa  632  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  49.8 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  47 
 
 		 735 aa  597  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  47.33 
 
 		 730 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  46.95 
 
 		 730 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  47.21 
 
 		 730 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  46.35 
 
 		 732 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  46.96 
 
 		 733 aa  568  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  45.28 
 
 		 658 aa  485  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  41.49 
 
 		 658 aa  476  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  32.96 
 
 		 780 aa  469  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  39.1 
 
 		 743 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  39.65 
 
 		 739 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.38 
 
 		 738 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  40.57 
 
 		 758 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  39.39 
 
 		 739 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  38.78 
 
 		 739 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  36.01 
 
 		 709 aa  454  1.0000000000000001e-126  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  38.51 
 
 		 739 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.76 
 
 		 739 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  40.45 
 
 		 739 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  38.73 
 
 		 746 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  38.37 
 
 		 739 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  38.1 
 
 		 739 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  36.35 
 
 		 736 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  36.12 
 
 		 733 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  38.04 
 
 		 752 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  38.17 
 
 		 752 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  38.1 
 
 		 744 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  39.2 
 
 		 733 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  35.46 
 
 		 731 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  36.25 
 
 		 733 aa  432  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  35.46 
 
 		 731 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4426  primosomal protein N'  35.33 
 
 		 731 aa  432  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  35.46 
 
 		 731 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  40.58 
 
 		 802 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  35.54 
 
 		 731 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  40.58 
 
 		 802 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  37.97 
 
 		 751 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  37.1 
 
 		 734 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  35.33 
 
 		 734 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  34.69 
 
 		 731 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  35.01 
 
 		 742 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  36.74 
 
 		 732 aa  422  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  36.04 
 
 		 731 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  35.45 
 
 		 736 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  34 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  35.63 
 
 		 731 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  35.4 
 
 		 736 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  35.4 
 
 		 736 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  38.26 
 
 		 720 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.26 
 
 		 754 aa  416  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  38.26 
 
 		 720 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  33.78 
 
 		 725 aa  416  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  40.6 
 
 		 802 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  36.11 
 
 		 733 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  37.78 
 
 		 744 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  35.01 
 
 		 737 aa  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  35.03 
 
 		 774 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  36.36 
 
 		 731 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  33.87 
 
 		 733 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  37 
 
 		 731 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  34.49 
 
 		 731 aa  412  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  35.53 
 
 		 798 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.44 
 
 		 732 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  33.78 
 
 		 753 aa  409  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  36.19 
 
 		 733 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>