More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2279 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  49.29 
 
 		 734 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  49.79 
 
 		 744 aa  657    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  48.19 
 
 		 738 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  51.4 
 
 		 744 aa  642    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  51.81 
 
 		 725 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  49.79 
 
 		 740 aa  661    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  48.06 
 
 		 738 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  51.2 
 
 		 738 aa  653    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  54.22 
 
 		 731 aa  753    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  51.03 
 
 		 725 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  51.97 
 
 		 735 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  64.36 
 
 		 733 aa  917    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  49.02 
 
 		 732 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  49.52 
 
 		 734 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  49.79 
 
 		 744 aa  656    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  52.65 
 
 		 729 aa  694    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  51.62 
 
 		 735 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  50.28 
 
 		 738 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 722 aa  1432    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  67.59 
 
 		 734 aa  980    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  49.31 
 
 		 726 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  50.07 
 
 		 736 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  52.8 
 
 		 759 aa  654    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  50.97 
 
 		 727 aa  666    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  50.99 
 
 		 736 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  51.33 
 
 		 727 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  51.03 
 
 		 725 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  49.05 
 
 		 736 aa  635  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  50.84 
 
 		 724 aa  634  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  47.36 
 
 		 745 aa  629  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  49.12 
 
 		 730 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  49.12 
 
 		 730 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  47.3 
 
 		 739 aa  626  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  48.38 
 
 		 727 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  48.83 
 
 		 730 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  49.59 
 
 		 730 aa  625  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  49.59 
 
 		 754 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  48.7 
 
 		 733 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  47.77 
 
 		 735 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  47.72 
 
 		 811 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  53.35 
 
 		 718 aa  580  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  35.31 
 
 		 658 aa  464  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  40.41 
 
 		 658 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.97 
 
 		 738 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  37.72 
 
 		 752 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  37.69 
 
 		 752 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  39.81 
 
 		 780 aa  440  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  35.68 
 
 		 709 aa  441  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  38.81 
 
 		 751 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  37.65 
 
 		 758 aa  432  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.62 
 
 		 754 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  37.89 
 
 		 804 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  44.1 
 
 		 858 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  36.39 
 
 		 738 aa  417  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  32.55 
 
 		 732 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  33.88 
 
 		 733 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 		 739 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  38.05 
 
 		 802 aa  415  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  36.28 
 
 		 746 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.62 
 
 		 802 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  36.46 
 
 		 743 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.62 
 
 		 802 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  38.45 
 
 		 739 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  36.8 
 
 		 736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.67 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  39.24 
 
 		 720 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  44.31 
 
 		 738 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  39.24 
 
 		 720 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.43 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.6 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  36.43 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  36.43 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  36.49 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0275  primosomal protein N'  39.81 
 
 		 737 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00025836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  39.41 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.66 
 
 		 774 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  36.43 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.21 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  36.79 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.84 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  36.43 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  36.02 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.43 
 
 		 801 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2327  primosomal protein N'  36.36 
 
 		 734 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0753846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  35.35 
 
 		 731 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  36.59 
 
 		 732 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  36.59 
 
 		 732 aa  399  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  36.65 
 
 		 746 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 		 732 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.99 
 
 		 739 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  36.73 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  33.2 
 
 		 745 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  36.73 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  35.77 
 
 		 731 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  33.29 
 
 		 725 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  32.66 
 
 		 730 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  34.39 
 
 		 798 aa  396  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  36.59 
 
 		 732 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  36.51 
 
 		 739 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  36.04 
 
 		 723 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>