More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1033 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  74.07 
 
 		 727 aa  1074    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  48.69 
 
 		 734 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  51.73 
 
 		 731 aa  726    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  49.39 
 
 		 744 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  49.45 
 
 		 736 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  49.26 
 
 		 744 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 		 738 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  50.82 
 
 		 730 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  47.86 
 
 		 738 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  69.32 
 
 		 730 aa  1003    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  69.45 
 
 		 730 aa  1000    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  48.41 
 
 		 738 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  49.04 
 
 		 727 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  49.31 
 
 		 725 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  62.36 
 
 		 733 aa  901    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  48.97 
 
 		 735 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 732 aa  1476    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  48.07 
 
 		 734 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  50.14 
 
 		 754 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  69.32 
 
 		 730 aa  1002    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  49.93 
 
 		 735 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  48.34 
 
 		 738 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  73.18 
 
 		 735 aa  1077    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  48.86 
 
 		 739 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  48.46 
 
 		 736 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  49.38 
 
 		 726 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  48.36 
 
 		 734 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  49.58 
 
 		 740 aa  674    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  50.07 
 
 		 744 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  49.45 
 
 		 736 aa  667    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  50.48 
 
 		 729 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  50.21 
 
 		 725 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  49.45 
 
 		 725 aa  634  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  47.32 
 
 		 733 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  46.99 
 
 		 745 aa  624  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  48.67 
 
 		 722 aa  622  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  47.1 
 
 		 727 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  45.13 
 
 		 811 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  47.87 
 
 		 724 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  47.19 
 
 		 759 aa  555  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  46.91 
 
 		 718 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  36.59 
 
 		 658 aa  473  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  35.13 
 
 		 658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.78 
 
 		 738 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  40.54 
 
 		 804 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  33.12 
 
 		 780 aa  444  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  40.14 
 
 		 745 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  38.8 
 
 		 751 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  41.04 
 
 		 801 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  43.17 
 
 		 828 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  36.86 
 
 		 752 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.92 
 
 		 802 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  37.72 
 
 		 802 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  37.72 
 
 		 802 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  34.74 
 
 		 709 aa  419  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  44.04 
 
 		 738 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.14 
 
 		 725 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.24 
 
 		 745 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  36.7 
 
 		 720 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  37.57 
 
 		 733 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.26 
 
 		 732 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  38.52 
 
 		 732 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  37.55 
 
 		 758 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  36.93 
 
 		 746 aa  412  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  36.7 
 
 		 720 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  40.43 
 
 		 858 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  36.29 
 
 		 731 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  34.72 
 
 		 747 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  38.03 
 
 		 735 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.87 
 
 		 725 aa  409  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  35.77 
 
 		 734 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.04 
 
 		 754 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.08 
 
 		 739 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  36.44 
 
 		 752 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  32.29 
 
 		 798 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  32.41 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  32.75 
 
 		 732 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  36.4 
 
 		 732 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  36.54 
 
 		 732 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  40.21 
 
 		 813 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  38.21 
 
 		 781 aa  405  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  34.01 
 
 		 733 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.94 
 
 		 739 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  38.95 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.99 
 
 		 739 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  38.14 
 
 		 740 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  34.6 
 
 		 733 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  35.52 
 
 		 801 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  36.96 
 
 		 740 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  35.67 
 
 		 801 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.06 
 
 		 739 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  37.3 
 
 		 746 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  39.03 
 
 		 662 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  36.72 
 
 		 739 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  34.1 
 
 		 733 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  38.93 
 
 		 809 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  36.11 
 
 		 732 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  34.98 
 
 		 815 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  34.96 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  40.45 
 
 		 803 aa  399  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>