More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2212 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  51.1 
 
 		 727 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  48.56 
 
 		 734 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  50.28 
 
 		 738 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  52.18 
 
 		 731 aa  713    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  51.35 
 
 		 744 aa  657    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  52.67 
 
 		 725 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  50.69 
 
 		 738 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  50.41 
 
 		 738 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  51.49 
 
 		 740 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  99.59 
 
 		 730 aa  1435    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  52.41 
 
 		 725 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  96.16 
 
 		 730 aa  1362    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  50.41 
 
 		 736 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  68.41 
 
 		 733 aa  951    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  51.46 
 
 		 735 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  69.32 
 
 		 732 aa  1003    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  50.28 
 
 		 734 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  51.83 
 
 		 735 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  50.76 
 
 		 738 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 730 aa  1439    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  51.99 
 
 		 725 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  50.34 
 
 		 734 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  72.73 
 
 		 735 aa  1033    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  50.28 
 
 		 726 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  50.27 
 
 		 736 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  50.83 
 
 		 736 aa  671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  51.48 
 
 		 744 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  50.64 
 
 		 739 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  74.97 
 
 		 727 aa  1068    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  51.44 
 
 		 729 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  50.89 
 
 		 730 aa  629  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  49.02 
 
 		 733 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  51.37 
 
 		 754 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  51.21 
 
 		 744 aa  624  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  47.44 
 
 		 745 aa  616  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  49.12 
 
 		 722 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  48.21 
 
 		 727 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  49.31 
 
 		 724 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  47.36 
 
 		 811 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  46.87 
 
 		 759 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  50.07 
 
 		 718 aa  529  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  41.47 
 
 		 658 aa  482  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  35.17 
 
 		 658 aa  473  1e-132  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  33.83 
 
 		 780 aa  451  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  40.68 
 
 		 738 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  38.49 
 
 		 804 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  38.96 
 
 		 751 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  41.6 
 
 		 745 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.66 
 
 		 732 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  41.1 
 
 		 801 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  36.27 
 
 		 736 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  35.18 
 
 		 709 aa  418  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.19 
 
 		 801 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.73 
 
 		 802 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  43.21 
 
 		 858 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 		 801 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  39.41 
 
 		 732 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 		 801 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.29 
 
 		 801 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.12 
 
 		 801 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.29 
 
 		 801 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  36.01 
 
 		 802 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.29 
 
 		 801 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  38.74 
 
 		 758 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  45.82 
 
 		 738 aa  412  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  37.79 
 
 		 752 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  36.01 
 
 		 802 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  36.75 
 
 		 732 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  41.96 
 
 		 662 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.33 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  37.79 
 
 		 752 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  37.58 
 
 		 739 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.05 
 
 		 745 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  39.54 
 
 		 739 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  37.45 
 
 		 731 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  41.77 
 
 		 662 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  40.68 
 
 		 724 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  37.45 
 
 		 739 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  37.43 
 
 		 720 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  37.3 
 
 		 746 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.67 
 
 		 774 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  40.82 
 
 		 765 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  37.43 
 
 		 720 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  39.13 
 
 		 739 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  33.99 
 
 		 781 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  38.47 
 
 		 733 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  38.04 
 
 		 744 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  36.01 
 
 		 732 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  37.16 
 
 		 723 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  35.96 
 
 		 732 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2672  replication restart DNA helicase PriA  37.79 
 
 		 738 aa  399  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.868647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  35.96 
 
 		 732 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.24 
 
 		 754 aa  399  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  37.89 
 
 		 743 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.5 
 
 		 739 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  38.14 
 
 		 735 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  40.69 
 
 		 765 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>