More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1594 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  46.93 
 
 		 747 aa  687    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  47.36 
 
 		 732 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  48.58 
 
 		 730 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  100 
 
 		 735 aa  1482    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  42.03 
 
 		 745 aa  601  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  41.57 
 
 		 732 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  42.5 
 
 		 801 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.27 
 
 		 731 aa  572  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  38.01 
 
 		 731 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  47.46 
 
 		 804 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  46.27 
 
 		 801 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  46.62 
 
 		 801 aa  548  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  46.27 
 
 		 801 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  46.1 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  46.1 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  46.1 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  46.1 
 
 		 801 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  46.1 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  46.1 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  46.19 
 
 		 801 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  39.12 
 
 		 749 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  43.75 
 
 		 815 aa  538  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  41.01 
 
 		 758 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  45.69 
 
 		 802 aa  532  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  42.18 
 
 		 752 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  44.89 
 
 		 801 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  42.91 
 
 		 754 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  41.78 
 
 		 752 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  41.42 
 
 		 744 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  46.41 
 
 		 802 aa  524  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  46.41 
 
 		 802 aa  524  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  44.95 
 
 		 798 aa  523  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  39.02 
 
 		 775 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  36.05 
 
 		 781 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  40.77 
 
 		 746 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  36.28 
 
 		 724 aa  515  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  45.92 
 
 		 809 aa  514  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  41.59 
 
 		 751 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  35.55 
 
 		 792 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  39.85 
 
 		 786 aa  508  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  38.34 
 
 		 813 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  41.86 
 
 		 818 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  39.71 
 
 		 768 aa  496  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  38.97 
 
 		 770 aa  496  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  44.79 
 
 		 803 aa  497  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  45.13 
 
 		 815 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  44.19 
 
 		 815 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  41.99 
 
 		 796 aa  492  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  39.76 
 
 		 745 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  39.63 
 
 		 738 aa  488  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  43.98 
 
 		 798 aa  486  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  39.64 
 
 		 780 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  45.58 
 
 		 835 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  40.21 
 
 		 732 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  45.56 
 
 		 815 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  44.32 
 
 		 866 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  46.28 
 
 		 828 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  44.85 
 
 		 868 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  42.11 
 
 		 803 aa  466  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  47.01 
 
 		 805 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  40.56 
 
 		 802 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  36.73 
 
 		 695 aa  453  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  41.9 
 
 		 825 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  41.07 
 
 		 661 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  41.03 
 
 		 835 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  36.57 
 
 		 790 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  41.09 
 
 		 914 aa  450  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  40.43 
 
 		 810 aa  452  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.16 
 
 		 738 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  40.31 
 
 		 848 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  44.78 
 
 		 829 aa  448  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  40.35 
 
 		 843 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  42.01 
 
 		 735 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  43.64 
 
 		 679 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  39.77 
 
 		 824 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  47.75 
 
 		 821 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  47.61 
 
 		 858 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  46.08 
 
 		 806 aa  438  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  39.76 
 
 		 812 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  44.99 
 
 		 836 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  38.32 
 
 		 849 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  40.36 
 
 		 810 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  38.69 
 
 		 810 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  32.85 
 
 		 753 aa  421  1e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  39.35 
 
 		 815 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  38.72 
 
 		 715 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  37.17 
 
 		 660 aa  416  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  37.76 
 
 		 811 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  37.06 
 
 		 815 aa  413  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  34.09 
 
 		 815 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  43.51 
 
 		 814 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  40.31 
 
 		 812 aa  415  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  36.05 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  37.12 
 
 		 739 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  39.85 
 
 		 815 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  36.93 
 
 		 743 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.99 
 
 		 739 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3727  primosomal protein N'  40.06 
 
 		 745 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  37.27 
 
 		 739 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  38.03 
 
 		 732 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>