More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2927 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  56.95 
 
 		 725 aa  794    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  50.89 
 
 		 730 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  57.2 
 
 		 725 aa  793    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  72.62 
 
 		 744 aa  1082    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  56.95 
 
 		 725 aa  795    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  55.85 
 
 		 731 aa  777    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  56.29 
 
 		 738 aa  773    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  55.87 
 
 		 754 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  82.14 
 
 		 738 aa  1246    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  54.46 
 
 		 736 aa  779    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  50.07 
 
 		 730 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  56.52 
 
 		 744 aa  790    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  49.1 
 
 		 734 aa  674    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  60.93 
 
 		 745 aa  887    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  50.34 
 
 		 730 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  72.6 
 
 		 740 aa  1086    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  55.59 
 
 		 735 aa  786    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  49.43 
 
 		 733 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  48.69 
 
 		 732 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  53.88 
 
 		 734 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  79.7 
 
 		 739 aa  1168    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  55.54 
 
 		 730 aa  765    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  55.76 
 
 		 735 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 734 aa  1478    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  55.05 
 
 		 738 aa  762    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  56.81 
 
 		 727 aa  808    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  82.14 
 
 		 738 aa  1218    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  48.06 
 
 		 735 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  48.94 
 
 		 722 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  54.56 
 
 		 736 aa  777    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  75.14 
 
 		 726 aa  1074    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  58.3 
 
 		 729 aa  808    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  55.82 
 
 		 736 aa  792    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  53.59 
 
 		 759 aa  671    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  50.55 
 
 		 727 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  49.31 
 
 		 724 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  72.75 
 
 		 744 aa  1083    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  48.49 
 
 		 733 aa  621  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  46.73 
 
 		 727 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  46.36 
 
 		 811 aa  601  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  50 
 
 		 718 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  41.85 
 
 		 658 aa  451  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  31.13 
 
 		 780 aa  442  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  40.22 
 
 		 658 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.2 
 
 		 738 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  36.14 
 
 		 709 aa  438  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  38.16 
 
 		 758 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  34.84 
 
 		 731 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  34.74 
 
 		 731 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  41.04 
 
 		 752 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.15 
 
 		 732 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.74 
 
 		 804 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.7 
 
 		 774 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  35.28 
 
 		 732 aa  396  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  35.01 
 
 		 725 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  32.48 
 
 		 733 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  32.62 
 
 		 745 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  36.81 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  33.33 
 
 		 742 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  34.74 
 
 		 731 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  34.79 
 
 		 731 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  41.04 
 
 		 752 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  33.92 
 
 		 731 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  34.47 
 
 		 733 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  37.57 
 
 		 744 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  33.7 
 
 		 733 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  34.6 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  34.74 
 
 		 731 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0445  primosomal protein N'  35.01 
 
 		 735 aa  389  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  33.83 
 
 		 732 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  34.2 
 
 		 733 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  32.02 
 
 		 730 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  34.24 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  34.24 
 
 		 731 aa  389  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  35.75 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  36.75 
 
 		 802 aa  385  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  35.85 
 
 		 739 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  33.42 
 
 		 732 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  33.47 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  33.97 
 
 		 732 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  36.86 
 
 		 745 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  33.11 
 
 		 734 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  34.32 
 
 		 736 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  34.32 
 
 		 736 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4426  primosomal protein N'  32.93 
 
 		 731 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  35.85 
 
 		 739 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  31.12 
 
 		 803 aa  385  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  35.75 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  34.27 
 
 		 736 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  35.4 
 
 		 801 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  36.54 
 
 		 751 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  35.22 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  35.22 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  35.22 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  35.21 
 
 		 739 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  35.22 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  35.59 
 
 		 743 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.3 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  35.31 
 
 		 739 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.44 
 
 		 746 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>