More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3213 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  74.97 
 
 		 744 aa  1103    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  71.43 
 
 		 739 aa  1040    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  74.97 
 
 		 740 aa  1108    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  56.14 
 
 		 738 aa  787    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  50.83 
 
 		 730 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  55.97 
 
 		 736 aa  811    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  73.75 
 
 		 738 aa  1102    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  50.28 
 
 		 730 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  55.96 
 
 		 736 aa  790    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  75.14 
 
 		 734 aa  1107    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  58.15 
 
 		 725 aa  808    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  58.29 
 
 		 725 aa  800    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  57.77 
 
 		 729 aa  800    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  75.1 
 
 		 744 aa  1104    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  56.15 
 
 		 735 aa  810    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  51.58 
 
 		 733 aa  680    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  49.38 
 
 		 732 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  59.15 
 
 		 730 aa  798    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  54.58 
 
 		 734 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  51.17 
 
 		 727 aa  666    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  56.32 
 
 		 735 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  54.79 
 
 		 738 aa  771    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  61.07 
 
 		 745 aa  884    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  56.96 
 
 		 731 aa  786    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  52.83 
 
 		 759 aa  677    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  49.24 
 
 		 735 aa  669    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  49.31 
 
 		 722 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  51.04 
 
 		 734 aa  694    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 726 aa  1458    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  74.17 
 
 		 738 aa  1083    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  57.04 
 
 		 727 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  54.67 
 
 		 744 aa  792    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  50.55 
 
 		 730 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  54.7 
 
 		 736 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  58.98 
 
 		 754 aa  792    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  58.29 
 
 		 725 aa  806    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  50.21 
 
 		 733 aa  634  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  50.41 
 
 		 724 aa  634  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  47.66 
 
 		 727 aa  629  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  47.2 
 
 		 811 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  51.79 
 
 		 718 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  37.33 
 
 		 709 aa  463  1e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  40.71 
 
 		 658 aa  461  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  31.32 
 
 		 780 aa  454  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  41.28 
 
 		 658 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.42 
 
 		 738 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  36.89 
 
 		 752 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  36.72 
 
 		 752 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  35.92 
 
 		 733 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  37.08 
 
 		 758 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  36.23 
 
 		 733 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  37.7 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  37.7 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  35.19 
 
 		 725 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.86 
 
 		 804 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.58 
 
 		 745 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  37.48 
 
 		 740 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  36.94 
 
 		 739 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  37.52 
 
 		 732 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  37.38 
 
 		 744 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  33.15 
 
 		 730 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  37.14 
 
 		 739 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  38.1 
 
 		 733 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  35.46 
 
 		 746 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  32.97 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  35.87 
 
 		 743 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  39.16 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  33.74 
 
 		 742 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  33.6 
 
 		 733 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  37.43 
 
 		 739 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  34.1 
 
 		 753 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  35.84 
 
 		 723 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  43.66 
 
 		 738 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  35.78 
 
 		 751 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.83 
 
 		 754 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  36.36 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  35.94 
 
 		 739 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  34.72 
 
 		 734 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  32.75 
 
 		 798 aa  391  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  36.5 
 
 		 809 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  36.27 
 
 		 802 aa  389  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  39.46 
 
 		 662 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.34 
 
 		 739 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  32.93 
 
 		 733 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  34.05 
 
 		 731 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  34.64 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  33.78 
 
 		 734 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  39.46 
 
 		 662 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  34.05 
 
 		 731 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  35.91 
 
 		 801 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  33.73 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  36.54 
 
 		 803 aa  386  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  34.05 
 
 		 731 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  35.74 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.84 
 
 		 801 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.38 
 
 		 725 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  36.39 
 
 		 739 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.46 
 
 		 801 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.64 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.87 
 
 		 746 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>