More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2378 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  47.17 
 
 		 738 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  47.35 
 
 		 734 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  72.73 
 
 		 730 aa  1048    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  49.1 
 
 		 744 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  48.13 
 
 		 736 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  64.98 
 
 		 733 aa  936    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  50.95 
 
 		 744 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  47.56 
 
 		 738 aa  636    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  49.24 
 
 		 744 aa  669    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  72.73 
 
 		 730 aa  1050    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  49.32 
 
 		 729 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  48.07 
 
 		 734 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  50 
 
 		 736 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  49.38 
 
 		 740 aa  674    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  47.7 
 
 		 735 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  47.3 
 
 		 733 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  73.18 
 
 		 732 aa  1087    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  48.53 
 
 		 735 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 735 aa  1476    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  49.24 
 
 		 726 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  47.43 
 
 		 738 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  72.73 
 
 		 730 aa  1049    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  50.42 
 
 		 731 aa  699    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  74.07 
 
 		 727 aa  1084    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  48.9 
 
 		 727 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  48.02 
 
 		 736 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  49.66 
 
 		 730 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  48.83 
 
 		 725 aa  635  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  48.97 
 
 		 725 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  49.38 
 
 		 725 aa  631  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  46.96 
 
 		 734 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  47.44 
 
 		 739 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  47.72 
 
 		 738 aa  628  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  49.25 
 
 		 754 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  45.22 
 
 		 745 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  47.77 
 
 		 722 aa  598  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  47.45 
 
 		 724 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  45.18 
 
 		 727 aa  585  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  47 
 
 		 759 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  43.7 
 
 		 811 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  47.1 
 
 		 718 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  40.26 
 
 		 658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  41.19 
 
 		 658 aa  465  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  39.27 
 
 		 738 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  33.71 
 
 		 780 aa  450  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.85 
 
 		 732 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 		 804 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  37.75 
 
 		 802 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.26 
 
 		 802 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.26 
 
 		 802 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  41.54 
 
 		 858 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  37.73 
 
 		 758 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  37.35 
 
 		 751 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  34.11 
 
 		 709 aa  417  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  39.54 
 
 		 801 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  35.44 
 
 		 736 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  36.44 
 
 		 734 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  37.37 
 
 		 745 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  36.89 
 
 		 752 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.94 
 
 		 725 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  35.47 
 
 		 733 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  36.57 
 
 		 752 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  36.29 
 
 		 740 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.92 
 
 		 801 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  38.36 
 
 		 781 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  36.97 
 
 		 801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  36.97 
 
 		 801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  36.97 
 
 		 801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.98 
 
 		 725 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  37.14 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.67 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  33.6 
 
 		 745 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  31.13 
 
 		 798 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.8 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  36.86 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.14 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  36.86 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  33.92 
 
 		 747 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.96 
 
 		 732 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.8 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  34.94 
 
 		 733 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  37.69 
 
 		 733 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.18 
 
 		 739 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  35.33 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  36.95 
 
 		 732 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  37.52 
 
 		 743 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  39.93 
 
 		 813 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  38.05 
 
 		 809 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  38.72 
 
 		 765 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  43.69 
 
 		 724 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  38.23 
 
 		 746 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  35.14 
 
 		 733 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  36.07 
 
 		 746 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  35.99 
 
 		 735 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  36.44 
 
 		 732 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  41.18 
 
 		 679 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  43.38 
 
 		 738 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  35.58 
 
 		 731 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  40.7 
 
 		 803 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  37.64 
 
 		 739 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>