More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1100 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  49.93 
 
 
734 aa  681    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  58.26 
 
 
725 aa  806    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  49.31 
 
 
724 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  57.89 
 
 
729 aa  810    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  94.22 
 
 
744 aa  1423    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  71.43 
 
 
739 aa  1065    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  51.65 
 
 
730 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  100 
 
 
740 aa  1501    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  56.49 
 
 
738 aa  800    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  72.6 
 
 
734 aa  1086    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  57.2 
 
 
754 aa  790    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  56.87 
 
 
736 aa  819    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  51.22 
 
 
730 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  56.81 
 
 
730 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  73.01 
 
 
738 aa  1078    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  57.71 
 
 
725 aa  811    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  58.05 
 
 
727 aa  827    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  49.79 
 
 
733 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  51.59 
 
 
727 aa  670    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  62.82 
 
 
745 aa  950    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  56.83 
 
 
735 aa  821    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  48.1 
 
 
733 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  49.58 
 
 
732 aa  664    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  54.62 
 
 
734 aa  779    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  54.15 
 
 
744 aa  789    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  56.88 
 
 
735 aa  809    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  56.79 
 
 
738 aa  798    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  57.58 
 
 
725 aa  811    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  72.57 
 
 
738 aa  1097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  49.38 
 
 
735 aa  669    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  49.79 
 
 
722 aa  643    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  94.35 
 
 
744 aa  1425    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  74.97 
 
 
726 aa  1075    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  50.33 
 
 
759 aa  655    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  57.28 
 
 
736 aa  816    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  51.49 
 
 
730 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  47.45 
 
 
727 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  56.21 
 
 
731 aa  775    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  55.34 
 
 
736 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  46.51 
 
 
811 aa  594  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  48.27 
 
 
718 aa  531  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  33.7 
 
 
658 aa  473  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  33.97 
 
 
658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  39.06 
 
 
738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  35.45 
 
 
709 aa  445  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  31.36 
 
 
780 aa  439  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  38.27 
 
 
758 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  37.58 
 
 
744 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.24 
 
 
732 aa  412  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 
732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  34.78 
 
 
732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  34.05 
 
 
733 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  43.3 
 
 
858 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  34.78 
 
 
732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  42.46 
 
 
752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  32.6 
 
 
730 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 
732 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  35.71 
 
 
739 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  42.28 
 
 
752 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  33.83 
 
 
731 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.71 
 
 
804 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.15 
 
 
745 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 
732 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  33.78 
 
 
733 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  37.5 
 
 
751 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 
732 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  34.47 
 
 
732 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  34.59 
 
 
742 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 
732 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 
732 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  38.7 
 
 
802 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  34.1 
 
 
731 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  33.96 
 
 
731 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  34.1 
 
 
731 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  38.31 
 
 
661 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  33.74 
 
 
731 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  33.96 
 
 
731 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  35.23 
 
 
739 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  34.1 
 
 
732 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  34.1 
 
 
732 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  35.49 
 
 
720 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  35.94 
 
 
739 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  33.69 
 
 
731 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  35.23 
 
 
739 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  31.89 
 
 
733 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  34.56 
 
 
732 aa  396  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  35.49 
 
 
720 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  32.62 
 
 
733 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  40.93 
 
 
813 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  33.88 
 
 
725 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  34.1 
 
 
732 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  32.48 
 
 
733 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  34.1 
 
 
732 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  39.35 
 
 
802 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.61 
 
 
725 aa  392  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.33 
 
 
725 aa  392  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.31 
 
 
746 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  32.22 
 
 
753 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  35.76 
 
 
739 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  33.56 
 
 
736 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>