More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1926 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  50.54 
 
 		 736 aa  655    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  49.93 
 
 		 738 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  51.03 
 
 		 725 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  51.57 
 
 		 744 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  49.79 
 
 		 738 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  49.73 
 
 		 738 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  74.97 
 
 		 730 aa  1069    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  50.89 
 
 		 725 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  53.06 
 
 		 731 aa  725    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  49.86 
 
 		 736 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  50.55 
 
 		 734 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  51.3 
 
 		 754 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  51.03 
 
 		 725 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  52.05 
 
 		 729 aa  668    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  66.35 
 
 		 733 aa  925    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  49.72 
 
 		 734 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  50.07 
 
 		 735 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  49.93 
 
 		 733 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  74.07 
 
 		 732 aa  1075    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  75.52 
 
 		 730 aa  1072    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  49.18 
 
 		 734 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  74.97 
 
 		 730 aa  1068    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  50.42 
 
 		 735 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  51.71 
 
 		 744 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  74.07 
 
 		 735 aa  1061    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  51.59 
 
 		 740 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  50.9 
 
 		 726 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  50.41 
 
 		 736 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  50.54 
 
 		 744 aa  640    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  51.16 
 
 		 727 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 727 aa  1452    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  51.17 
 
 		 730 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  48.9 
 
 		 739 aa  628  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  49.04 
 
 		 738 aa  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  51.33 
 
 		 722 aa  628  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  47.41 
 
 		 745 aa  612  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  50.21 
 
 		 724 aa  612  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  48.43 
 
 		 727 aa  612  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  49.52 
 
 		 759 aa  586  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  44.28 
 
 		 811 aa  549  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  49.38 
 
 		 718 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  35.87 
 
 		 658 aa  480  1e-134  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  34.71 
 
 		 658 aa  480  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  40.33 
 
 		 738 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  31.77 
 
 		 780 aa  446  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  34.72 
 
 		 709 aa  434  1e-120  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  41.19 
 
 		 745 aa  432  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  35.21 
 
 		 745 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  39.07 
 
 		 802 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.11 
 
 		 725 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  37.96 
 
 		 804 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  36.46 
 
 		 752 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  36.07 
 
 		 736 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.97 
 
 		 725 aa  416  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  38.79 
 
 		 802 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  38.79 
 
 		 802 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  38.12 
 
 		 758 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  42.88 
 
 		 738 aa  415  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  36.2 
 
 		 752 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4126  primosomal protein N'  35.03 
 
 		 743 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000536083  hitchhiker  0.00000144445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.82 
 
 		 801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.11 
 
 		 732 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  36.34 
 
 		 731 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  37.58 
 
 		 739 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  36.9 
 
 		 781 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  37.19 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  36.42 
 
 		 743 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.65 
 
 		 739 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.66 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  37.22 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  37.3 
 
 		 732 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  35.47 
 
 		 742 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.93 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.22 
 
 		 739 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  37.79 
 
 		 740 aa  405  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  37.19 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  41.9 
 
 		 858 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  37.22 
 
 		 801 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  37.92 
 
 		 751 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  35.3 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  42.4 
 
 		 679 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  35.24 
 
 		 731 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  36.81 
 
 		 801 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  35.85 
 
 		 739 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  38.25 
 
 		 732 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  34.37 
 
 		 747 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  37.91 
 
 		 732 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4426  primosomal protein N'  35.74 
 
 		 731 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  39.86 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.66 
 
 		 739 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  39.2 
 
 		 813 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  36.63 
 
 		 798 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  36.86 
 
 		 746 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  36.7 
 
 		 731 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  36.56 
 
 		 731 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>