More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0206 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  100 
 
 
709 aa  1459    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  37.15 
 
 
724 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  44.01 
 
 
658 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  36.06 
 
 
658 aa  468  9.999999999999999e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  37.29 
 
 
738 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  37.33 
 
 
726 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  36.62 
 
 
745 aa  459  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  36.26 
 
 
744 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  36.26 
 
 
744 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  34.84 
 
 
725 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  36.62 
 
 
738 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  35.45 
 
 
740 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  35.92 
 
 
734 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  35.9 
 
 
731 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  34.7 
 
 
725 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  36.14 
 
 
734 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  34.92 
 
 
725 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  34.87 
 
 
729 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  34.52 
 
 
727 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  36.01 
 
 
759 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  34.84 
 
 
735 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  33.97 
 
 
736 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  34.75 
 
 
734 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  34.89 
 
 
735 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  34.75 
 
 
738 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  34.69 
 
 
736 aa  439  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  34.84 
 
 
738 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  34.72 
 
 
727 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  35.54 
 
 
722 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  35.17 
 
 
739 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  34.24 
 
 
730 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  34.59 
 
 
736 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  35 
 
 
727 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  35.8 
 
 
733 aa  429  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  34.4 
 
 
744 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  34.11 
 
 
735 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  33.79 
 
 
754 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  35.32 
 
 
730 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  35.04 
 
 
730 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  34.74 
 
 
732 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  35.18 
 
 
730 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  34.97 
 
 
733 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  41.33 
 
 
780 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  35.46 
 
 
718 aa  405  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  32.36 
 
 
745 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  33.16 
 
 
754 aa  364  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  32.86 
 
 
744 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  32.36 
 
 
758 aa  360  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  35.7 
 
 
804 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  32.31 
 
 
732 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  33.64 
 
 
765 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  31.38 
 
 
751 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  36.06 
 
 
801 aa  351  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  35.5 
 
 
801 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  31.79 
 
 
734 aa  350  6e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  35.89 
 
 
801 aa  350  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  34.02 
 
 
801 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  34.02 
 
 
801 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  35.32 
 
 
801 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  35.12 
 
 
801 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  35.12 
 
 
801 aa  348  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  35.12 
 
 
801 aa  348  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  35.12 
 
 
801 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  31.95 
 
 
724 aa  347  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  31.74 
 
 
733 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  30.83 
 
 
738 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  36.05 
 
 
661 aa  345  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  37.55 
 
 
790 aa  345  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  34.67 
 
 
803 aa  345  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  35.88 
 
 
809 aa  343  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  35.62 
 
 
813 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  32.34 
 
 
733 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  31.85 
 
 
749 aa  341  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  30.19 
 
 
746 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  34.55 
 
 
801 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  30.73 
 
 
774 aa  340  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  31.08 
 
 
752 aa  341  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  33.51 
 
 
765 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  30.97 
 
 
752 aa  340  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  31.2 
 
 
733 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  31.8 
 
 
733 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  31.01 
 
 
733 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  31.09 
 
 
734 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  33.77 
 
 
835 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  30.03 
 
 
731 aa  334  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  31.57 
 
 
731 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  33.56 
 
 
802 aa  334  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  33.56 
 
 
802 aa  334  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  31.35 
 
 
731 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  34.79 
 
 
812 aa  333  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  30.8 
 
 
731 aa  333  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  31.62 
 
 
731 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  31.62 
 
 
731 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  33.39 
 
 
815 aa  333  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3889  primosome assembly protein PriA  34.4 
 
 
748 aa  333  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3022  primosome assembly protein PriA  34.55 
 
 
752 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  32.19 
 
 
720 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  32.19 
 
 
720 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  33.17 
 
 
843 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  30.91 
 
 
715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>