More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1677 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  61.44 
 
 		 759 aa  776    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  52.19 
 
 		 730 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  52.85 
 
 		 725 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  52.36 
 
 		 744 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  50.76 
 
 		 736 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  50 
 
 		 734 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  52.14 
 
 		 738 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  52.08 
 
 		 731 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  52.59 
 
 		 729 aa  666    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  51.91 
 
 		 727 aa  670    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  53.35 
 
 		 725 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  52.72 
 
 		 725 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  51.01 
 
 		 736 aa  638    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  51.59 
 
 		 735 aa  689    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  50.77 
 
 		 733 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  50.28 
 
 		 734 aa  665    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  50.28 
 
 		 734 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  51.4 
 
 		 735 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  50.76 
 
 		 738 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 718 aa  1394    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  53.35 
 
 		 722 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  51.38 
 
 		 736 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  52.1 
 
 		 754 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  48.89 
 
 		 738 aa  625  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  51.19 
 
 		 811 aa  625  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  48.41 
 
 		 740 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  50 
 
 		 726 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  49.18 
 
 		 744 aa  609  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  49.31 
 
 		 738 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  49.18 
 
 		 744 aa  609  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  49.66 
 
 		 727 aa  610  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  46.58 
 
 		 745 aa  607  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  50 
 
 		 730 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  50.07 
 
 		 730 aa  602  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  47.59 
 
 		 732 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  48.34 
 
 		 739 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  49.52 
 
 		 730 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  47.24 
 
 		 735 aa  597  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  48 
 
 		 727 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  49.59 
 
 		 724 aa  587  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  48.44 
 
 		 733 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  39.54 
 
 		 738 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  39.56 
 
 		 658 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  39.33 
 
 		 658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  39.15 
 
 		 758 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  35.6 
 
 		 709 aa  445  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  37.98 
 
 		 752 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4426  primosomal protein N'  36.5 
 
 		 731 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  39.29 
 
 		 751 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  39.45 
 
 		 780 aa  430  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  37.45 
 
 		 752 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  34.95 
 
 		 742 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  35.9 
 
 		 731 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  36.12 
 
 		 736 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  38.84 
 
 		 804 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  36.77 
 
 		 731 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  35.98 
 
 		 736 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  35.62 
 
 		 731 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  36.62 
 
 		 731 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  35.48 
 
 		 731 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  35.98 
 
 		 736 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  35.44 
 
 		 737 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  38.11 
 
 		 744 aa  416  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  37.35 
 
 		 743 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.06 
 
 		 754 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  34.78 
 
 		 731 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  37.71 
 
 		 746 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  36.13 
 
 		 731 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  43.81 
 
 		 858 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  39.12 
 
 		 739 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  34.78 
 
 		 733 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.39 
 
 		 739 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  36.52 
 
 		 736 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.6 
 
 		 732 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  34.32 
 
 		 733 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  34.72 
 
 		 753 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  34.99 
 
 		 734 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  38.38 
 
 		 739 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  41.48 
 
 		 813 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  34.29 
 
 		 733 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  34.5 
 
 		 731 aa  405  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.5 
 
 		 739 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  37.5 
 
 		 739 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  32.55 
 
 		 725 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0445  primosomal protein N'  36.83 
 
 		 735 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  40.3 
 
 		 745 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.46 
 
 		 774 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  36.12 
 
 		 734 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40.31 
 
 		 801 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  32.42 
 
 		 725 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  37.18 
 
 		 801 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  33.47 
 
 		 745 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  41.85 
 
 		 738 aa  402  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  40.67 
 
 		 739 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  39.5 
 
 		 803 aa  401  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  36.41 
 
 		 801 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  40.89 
 
 		 724 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.59 
 
 		 801 aa  399  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  37.32 
 
 		 801 aa  399  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  35.55 
 
 		 747 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>