More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2807 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  58.67 
 
 		 724 aa  770    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  48.1 
 
 		 744 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  49.45 
 
 		 727 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  51.11 
 
 		 731 aa  709    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  48.69 
 
 		 736 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  47.45 
 
 		 740 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  48.1 
 
 		 744 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 727 aa  1455    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  48.2 
 
 		 735 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  46.87 
 
 		 738 aa  628  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  48 
 
 		 734 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  46.89 
 
 		 734 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  48.74 
 
 		 735 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  48.14 
 
 		 736 aa  625  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  47.84 
 
 		 738 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  46.73 
 
 		 734 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  47.3 
 
 		 739 aa  618  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  46.57 
 
 		 738 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  47.66 
 
 		 726 aa  614  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  48.48 
 
 		 725 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  48.85 
 
 		 759 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  48.08 
 
 		 729 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  47.16 
 
 		 738 aa  611  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  48.62 
 
 		 725 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  48.48 
 
 		 725 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  48.38 
 
 		 722 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  48.56 
 
 		 727 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  46.81 
 
 		 736 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  48.21 
 
 		 730 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  48.28 
 
 		 754 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  46.12 
 
 		 733 aa  598  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  48.21 
 
 		 730 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  48.21 
 
 		 730 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  47.72 
 
 		 730 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  47.1 
 
 		 732 aa  585  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  45.29 
 
 		 745 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  45.96 
 
 		 744 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  46.31 
 
 		 733 aa  571  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  45.18 
 
 		 735 aa  572  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  47.86 
 
 		 718 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  37.07 
 
 		 752 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  37.2 
 
 		 752 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  31.92 
 
 		 780 aa  426  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  40.73 
 
 		 658 aa  428  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  40.15 
 
 		 658 aa  428  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  35 
 
 		 709 aa  424  1e-117  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  36.89 
 
 		 738 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.33 
 
 		 758 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  37.86 
 
 		 720 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.72 
 
 		 754 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  37.86 
 
 		 720 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  35.89 
 
 		 739 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  35.76 
 
 		 739 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  41.8 
 
 		 858 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  37.88 
 
 		 732 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.63 
 
 		 746 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  36.05 
 
 		 739 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  34.28 
 
 		 736 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  35.52 
 
 		 744 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  35.59 
 
 		 751 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  37.77 
 
 		 740 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  35.66 
 
 		 723 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  36.41 
 
 		 815 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  35.54 
 
 		 739 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  35.97 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  35.7 
 
 		 739 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  37.12 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  35.66 
 
 		 739 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  42.75 
 
 		 738 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  34.82 
 
 		 733 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  36.68 
 
 		 732 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  35.2 
 
 		 731 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  36.17 
 
 		 745 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  41.37 
 
 		 744 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  33.38 
 
 		 774 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  34.72 
 
 		 731 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  33.06 
 
 		 734 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  34.86 
 
 		 731 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  35.03 
 
 		 743 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  37.88 
 
 		 804 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  34.5 
 
 		 736 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  34.54 
 
 		 736 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  34.69 
 
 		 733 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  34.86 
 
 		 731 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  34.36 
 
 		 736 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  33.96 
 
 		 737 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  33.16 
 
 		 753 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  34.72 
 
 		 731 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  33.42 
 
 		 731 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  39.82 
 
 		 813 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03519  primosome assembly protein PriA  33.91 
 
 		 729 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.822304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  33.89 
 
 		 818 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  36.2 
 
 		 745 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  33.6 
 
 		 746 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  33.83 
 
 		 735 aa  365  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  31.02 
 
 		 732 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  33.29 
 
 		 742 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  32.88 
 
 		 733 aa  361  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  32.74 
 
 		 733 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  32.21 
 
 		 725 aa  360  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>