More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1010 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  57.58 
 
 		 740 aa  811    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  56.95 
 
 		 734 aa  795    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  57.46 
 
 		 744 aa  792    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  51.98 
 
 		 724 aa  648    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  58.43 
 
 		 744 aa  820    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  57.84 
 
 		 738 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  51.13 
 
 		 734 aa  662    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  55.91 
 
 		 738 aa  788    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  59.95 
 
 		 727 aa  843    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 725 aa  1448    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  51.57 
 
 		 745 aa  728    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  52.7 
 
 		 733 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  58.05 
 
 		 736 aa  823    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  78.54 
 
 		 730 aa  1120    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  56.43 
 
 		 739 aa  771    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  57.66 
 
 		 735 aa  818    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  50 
 
 		 733 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  56.47 
 
 		 734 aa  791    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  57.46 
 
 		 744 aa  791    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  81.62 
 
 		 729 aa  1191    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  58.04 
 
 		 735 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  56.14 
 
 		 738 aa  782    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  55.79 
 
 		 736 aa  782    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  56.95 
 
 		 736 aa  808    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  51.03 
 
 		 722 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  95.86 
 
 		 725 aa  1377    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  58.15 
 
 		 726 aa  789    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  54.5 
 
 		 731 aa  738    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  52.65 
 
 		 759 aa  665    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  51.03 
 
 		 727 aa  644    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  57.7 
 
 		 738 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  99.45 
 
 		 725 aa  1441    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  78.13 
 
 		 754 aa  1095    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  51.24 
 
 		 730 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  52.13 
 
 		 730 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  51.99 
 
 		 730 aa  631  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  49.45 
 
 		 732 aa  629  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  48.62 
 
 		 811 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  48.69 
 
 		 735 aa  615  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  48.48 
 
 		 727 aa  610  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  51.77 
 
 		 718 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  35.11 
 
 		 658 aa  479  1e-134  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  34.92 
 
 		 658 aa  473  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  33.75 
 
 		 780 aa  470  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  39.46 
 
 		 738 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  39.19 
 
 		 752 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  38.65 
 
 		 752 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  34.84 
 
 		 709 aa  442  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  42.55 
 
 		 804 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  38.62 
 
 		 758 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  38.24 
 
 		 754 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  37.06 
 
 		 743 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  46.28 
 
 		 858 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  33.09 
 
 		 802 aa  419  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  38.34 
 
 		 739 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  37.75 
 
 		 739 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  37.47 
 
 		 746 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.6 
 
 		 739 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.61 
 
 		 745 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  37.47 
 
 		 739 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.15 
 
 		 732 aa  412  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  33.83 
 
 		 733 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  35.83 
 
 		 734 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  37.67 
 
 		 744 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  37.17 
 
 		 746 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  32.97 
 
 		 730 aa  412  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  36.75 
 
 		 679 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  37.68 
 
 		 739 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.01 
 
 		 739 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  39.5 
 
 		 802 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  39.5 
 
 		 802 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  33.69 
 
 		 733 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  37.03 
 
 		 744 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  38.77 
 
 		 733 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  35.49 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  34.05 
 
 		 733 aa  405  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  34.81 
 
 		 731 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  37.22 
 
 		 739 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  38.65 
 
 		 739 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  36.08 
 
 		 815 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  38.81 
 
 		 740 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.48 
 
 		 801 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  38.1 
 
 		 732 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  35.37 
 
 		 742 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  37.41 
 
 		 720 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  37.41 
 
 		 720 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  32.91 
 
 		 798 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  36.04 
 
 		 803 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  38.57 
 
 		 801 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  38.03 
 
 		 745 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  38.76 
 
 		 801 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  42.26 
 
 		 813 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  44.3 
 
 		 814 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  38.45 
 
 		 801 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  37.32 
 
 		 751 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  38.63 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  38.63 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  38.63 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.29 
 
 		 774 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  38.63 
 
 		 801 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>