More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0483 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  82.83 
 
 
658 aa  1154    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  100 
 
 
658 aa  1343    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  54.42 
 
 
780 aa  553  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  37.08 
 
 
731 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  35.99 
 
 
738 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  34.32 
 
 
736 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  36 
 
 
734 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  35.85 
 
 
738 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  42.97 
 
 
730 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  42.97 
 
 
730 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  42.77 
 
 
730 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  38.74 
 
 
734 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  34.99 
 
 
736 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  34.92 
 
 
725 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  42.7 
 
 
736 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  34.92 
 
 
725 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  34.71 
 
 
727 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  37.88 
 
 
735 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  33.7 
 
 
740 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  34.06 
 
 
725 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  41.74 
 
 
727 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  42.12 
 
 
735 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  40.6 
 
 
733 aa  472  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  41.04 
 
 
744 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  41.04 
 
 
744 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  42.2 
 
 
729 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  40.73 
 
 
735 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  36.59 
 
 
732 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  41.51 
 
 
724 aa  462  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  34.02 
 
 
745 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  44.42 
 
 
709 aa  456  1e-127  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 
726 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  43.24 
 
 
759 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  41.04 
 
 
730 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  40.97 
 
 
739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  40.89 
 
 
738 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  41.27 
 
 
754 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  41.09 
 
 
722 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  40.89 
 
 
738 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  40.07 
 
 
733 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  40.22 
 
 
734 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  40.07 
 
 
744 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  40.15 
 
 
727 aa  428  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  39.88 
 
 
718 aa  412  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  34.59 
 
 
679 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  38.66 
 
 
733 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  36.34 
 
 
662 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  36.04 
 
 
662 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  34.98 
 
 
660 aa  379  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  35.96 
 
 
746 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  36.15 
 
 
739 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  36.33 
 
 
738 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  35.78 
 
 
739 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  36.76 
 
 
739 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  38.52 
 
 
733 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  35.85 
 
 
858 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  35.22 
 
 
811 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  35.78 
 
 
739 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  39.17 
 
 
733 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  36.4 
 
 
739 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0166  primosome assembly protein PriA  33.29 
 
 
704 aa  370  1e-101  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  36.03 
 
 
744 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  37.34 
 
 
731 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  36.25 
 
 
736 aa  365  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  37.89 
 
 
734 aa  365  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  39.34 
 
 
725 aa  363  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  39.11 
 
 
725 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  35.21 
 
 
739 aa  362  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  36.28 
 
 
733 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  36.93 
 
 
730 aa  362  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  36.83 
 
 
732 aa  361  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  36.83 
 
 
732 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  32.7 
 
 
804 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  35.3 
 
 
732 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  36.07 
 
 
736 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  36.83 
 
 
732 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  35.54 
 
 
731 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  35.67 
 
 
732 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  37.13 
 
 
753 aa  356  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  36.26 
 
 
736 aa  356  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  36.78 
 
 
758 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  36.4 
 
 
732 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  36.4 
 
 
732 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  35.86 
 
 
732 aa  356  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  34.2 
 
 
738 aa  355  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  35.04 
 
 
814 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  36.4 
 
 
732 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  36.4 
 
 
732 aa  355  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  36.4 
 
 
732 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  35.92 
 
 
732 aa  355  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  31.32 
 
 
737 aa  355  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  37.38 
 
 
802 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  36.4 
 
 
732 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  36.07 
 
 
732 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  37.38 
 
 
802 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 
732 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  34.85 
 
 
732 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 
732 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  30.91 
 
 
731 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  36.45 
 
 
732 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>