More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0727 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  97.83 
 
 
736 aa  1262    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  82.74 
 
 
735 aa  1082    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  100 
 
 
736 aa  1426    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  97.83 
 
 
736 aa  1234    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  44.74 
 
 
758 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  45.83 
 
 
746 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  43.91 
 
 
752 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  45.82 
 
 
744 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  45.57 
 
 
751 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  43.82 
 
 
752 aa  555  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  52.71 
 
 
858 aa  549  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  44.36 
 
 
732 aa  545  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  37.77 
 
 
732 aa  534  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  43.66 
 
 
754 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  37.11 
 
 
745 aa  522  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  40.03 
 
 
732 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40.38 
 
 
801 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  42.45 
 
 
738 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  43.7 
 
 
804 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  39.52 
 
 
747 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  36.03 
 
 
798 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  41.21 
 
 
745 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  45.37 
 
 
813 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  35.1 
 
 
803 aa  482  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  43.41 
 
 
730 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  39.14 
 
 
770 aa  479  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  38.57 
 
 
825 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  35.58 
 
 
781 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  35.15 
 
 
801 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  42.56 
 
 
809 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  40.92 
 
 
738 aa  471  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  36.38 
 
 
749 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  35.33 
 
 
724 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  40.07 
 
 
801 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  39.07 
 
 
801 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  41.37 
 
 
735 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  40.3 
 
 
732 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  40.3 
 
 
732 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  39.61 
 
 
801 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  39.45 
 
 
801 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  39.45 
 
 
801 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  39.29 
 
 
801 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  39.45 
 
 
801 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  39.45 
 
 
801 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  40.3 
 
 
732 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  40.16 
 
 
732 aa  463  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  41.53 
 
 
739 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  41.59 
 
 
661 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  39.74 
 
 
801 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  34.22 
 
 
796 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  33.05 
 
 
815 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  42.05 
 
 
802 aa  462  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  42.05 
 
 
802 aa  462  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  35.42 
 
 
802 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  41.4 
 
 
739 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  42.72 
 
 
802 aa  458  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  38.75 
 
 
768 aa  458  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  45.81 
 
 
679 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  39.81 
 
 
732 aa  458  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  39.14 
 
 
732 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  45.82 
 
 
835 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  39.65 
 
 
731 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2672  replication restart DNA helicase PriA  39.46 
 
 
738 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.868647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  40.3 
 
 
732 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  40.16 
 
 
732 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  40.16 
 
 
732 aa  459  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  39.62 
 
 
732 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  35.65 
 
 
730 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  40.16 
 
 
732 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  39.04 
 
 
746 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  39.81 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  40.16 
 
 
732 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  39.3 
 
 
739 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  38.88 
 
 
868 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  39.78 
 
 
732 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  39.81 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  39.14 
 
 
732 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  39.14 
 
 
732 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  38.7 
 
 
801 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  32.43 
 
 
731 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  38.93 
 
 
739 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  38.93 
 
 
739 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  47.95 
 
 
828 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  31.6 
 
 
790 aa  450  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.66 
 
 
739 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  39.3 
 
 
731 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  38.35 
 
 
786 aa  452  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  32.29 
 
 
731 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  38.62 
 
 
818 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  35.1 
 
 
798 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  40.94 
 
 
733 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  40.83 
 
 
815 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  39.04 
 
 
739 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  38.99 
 
 
743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  39.35 
 
 
780 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  47.13 
 
 
821 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  38.6 
 
 
732 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  37.18 
 
 
733 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  48.94 
 
 
814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  37.15 
 
 
742 aa  446  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>