More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0043 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  100 
 
 		 738 aa  1515    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  42.06 
 
 		 745 aa  590  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.68 
 
 		 804 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  38.74 
 
 		 801 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  38.61 
 
 		 801 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  38.79 
 
 		 802 aa  545  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  38.67 
 
 		 732 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  40.71 
 
 		 801 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  44.75 
 
 		 801 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 		 801 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 		 801 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  44.75 
 
 		 801 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 		 801 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 		 801 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  44.43 
 
 		 801 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  39.16 
 
 		 802 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  44.59 
 
 		 801 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  39.21 
 
 		 745 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  39.16 
 
 		 802 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  38.64 
 
 		 798 aa  531  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  38.94 
 
 		 781 aa  528  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  43.62 
 
 		 801 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  40.48 
 
 		 754 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  39.7 
 
 		 758 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  40.03 
 
 		 752 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  43.67 
 
 		 798 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  40.19 
 
 		 732 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  43.3 
 
 		 812 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  37.32 
 
 		 749 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  43.63 
 
 		 809 aa  501  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  39.15 
 
 		 751 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  43.12 
 
 		 796 aa  498  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  39.37 
 
 		 752 aa  498  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  36.14 
 
 		 803 aa  498  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  36.14 
 
 		 731 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  38.91 
 
 		 747 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  37.72 
 
 		 815 aa  491  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  43.87 
 
 		 803 aa  492  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  39.49 
 
 		 818 aa  488  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  39.63 
 
 		 735 aa  488  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  38.85 
 
 		 746 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  35.61 
 
 		 731 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  41.07 
 
 		 815 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  39.22 
 
 		 732 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  42.39 
 
 		 811 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  41.03 
 
 		 810 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  46.42 
 
 		 815 aa  478  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  41.73 
 
 		 744 aa  479  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  43.07 
 
 		 815 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  37.3 
 
 		 724 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  36.83 
 
 		 768 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  44.22 
 
 		 661 aa  473  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  37.81 
 
 		 775 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  37.92 
 
 		 786 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  36.09 
 
 		 790 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  42.3 
 
 		 813 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  38.74 
 
 		 812 aa  469  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  45.6 
 
 		 828 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  37.28 
 
 		 730 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  38.26 
 
 		 739 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  39.81 
 
 		 730 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  38.63 
 
 		 739 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  38.36 
 
 		 746 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  42.35 
 
 		 810 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  38.26 
 
 		 739 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  38.46 
 
 		 739 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  39.32 
 
 		 739 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  42.55 
 
 		 810 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  36.82 
 
 		 792 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  38.13 
 
 		 739 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  38.6 
 
 		 743 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  42.72 
 
 		 815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  36.7 
 
 		 738 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  35.62 
 
 		 753 aa  452  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  38.04 
 
 		 739 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  37.95 
 
 		 744 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  38.61 
 
 		 732 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  38.61 
 
 		 732 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  38.61 
 
 		 732 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  34.94 
 
 		 715 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0275  primosomal protein N'  39.11 
 
 		 737 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00025836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  37.9 
 
 		 739 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  40.36 
 
 		 858 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  37.98 
 
 		 732 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  38.47 
 
 		 732 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  33.54 
 
 		 802 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  37 
 
 		 731 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  37.98 
 
 		 732 aa  446  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  37.98 
 
 		 732 aa  446  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  37.28 
 
 		 780 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  36.94 
 
 		 736 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.12 
 
 		 774 aa  445  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  37.98 
 
 		 732 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  37.98 
 
 		 732 aa  446  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  37.91 
 
 		 732 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  37.04 
 
 		 734 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4126  primosomal protein N'  36.33 
 
 		 743 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000536083  hitchhiker  0.00000144445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  42.98 
 
 		 835 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  40.78 
 
 		 738 aa  442  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  37.71 
 
 		 770 aa  439  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>