More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1417 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  100 
 
 		 810 aa  1668    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  54.93 
 
 		 811 aa  904    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  56.3 
 
 		 810 aa  916    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  61.23 
 
 		 815 aa  1030    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  65.8 
 
 		 810 aa  1118    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  55.89 
 
 		 812 aa  924    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  64.9 
 
 		 812 aa  1090    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  39.55 
 
 		 802 aa  572  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  41.85 
 
 		 828 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  37.64 
 
 		 802 aa  535  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  37.64 
 
 		 802 aa  535  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  37.9 
 
 		 801 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  34.9 
 
 		 815 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.06 
 
 		 801 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.06 
 
 		 801 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.06 
 
 		 801 aa  512  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  36.29 
 
 		 809 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  35.98 
 
 		 801 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  35.82 
 
 		 801 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  35.42 
 
 		 801 aa  505  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  35.42 
 
 		 801 aa  505  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  35.42 
 
 		 801 aa  505  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  35.42 
 
 		 801 aa  505  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  35.42 
 
 		 801 aa  505  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  35.82 
 
 		 801 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  36.99 
 
 		 804 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  36.67 
 
 		 798 aa  498  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  36.67 
 
 		 747 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  35.48 
 
 		 818 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  37.33 
 
 		 781 aa  488  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  36.64 
 
 		 796 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  36.17 
 
 		 803 aa  481  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  41.69 
 
 		 732 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  39.72 
 
 		 732 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  42.74 
 
 		 745 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  36.86 
 
 		 798 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  41.69 
 
 		 803 aa  468  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  42.55 
 
 		 738 aa  456  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  40.43 
 
 		 735 aa  452  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  34.98 
 
 		 824 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  40.83 
 
 		 715 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  34.35 
 
 		 831 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  41.29 
 
 		 813 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  38.75 
 
 		 731 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  40.71 
 
 		 758 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  35.27 
 
 		 868 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.41 
 
 		 815 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  35.19 
 
 		 745 aa  445  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  38.23 
 
 		 731 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  41.82 
 
 		 661 aa  443  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  37.32 
 
 		 815 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  39.25 
 
 		 752 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  41.73 
 
 		 749 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  35.08 
 
 		 866 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  41.35 
 
 		 732 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  39.25 
 
 		 752 aa  436  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  35.97 
 
 		 835 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  34.96 
 
 		 858 aa  436  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  34.32 
 
 		 775 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  39.25 
 
 		 730 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  34.26 
 
 		 751 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  34.07 
 
 		 815 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  40.06 
 
 		 744 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  33.55 
 
 		 790 aa  432  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  37.19 
 
 		 815 aa  432  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  35.17 
 
 		 815 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  34.07 
 
 		 802 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  41 
 
 		 746 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  37.23 
 
 		 825 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  43.56 
 
 		 679 aa  426  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  34.16 
 
 		 804 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  38.45 
 
 		 849 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  36.67 
 
 		 815 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  40.55 
 
 		 743 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  41.67 
 
 		 734 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  35.11 
 
 		 821 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  35.83 
 
 		 914 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  41.57 
 
 		 724 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  34.53 
 
 		 814 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  35.44 
 
 		 835 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  38.92 
 
 		 733 aa  415  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  39.36 
 
 		 754 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  36.29 
 
 		 836 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  40.13 
 
 		 739 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  38.89 
 
 		 733 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  33.17 
 
 		 832 aa  416  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.72 
 
 		 738 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  40.07 
 
 		 732 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  41.32 
 
 		 731 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  39.71 
 
 		 739 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  39.71 
 
 		 739 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  41.95 
 
 		 780 aa  411  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  38.7 
 
 		 733 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  39.76 
 
 		 753 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  39.8 
 
 		 739 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  35.19 
 
 		 843 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  38.83 
 
 		 732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  41.11 
 
 		 736 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  40.21 
 
 		 848 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  39.05 
 
 		 746 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>