More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2597 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  49.55 
 
 		 804 aa  815    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  43.16 
 
 		 824 aa  676    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  43.56 
 
 		 815 aa  693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  48.65 
 
 		 831 aa  857    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  40.68 
 
 		 817 aa  636    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  45.62 
 
 		 832 aa  734    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  42.04 
 
 		 815 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  100 
 
 		 815 aa  1687    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  40.83 
 
 		 815 aa  655    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  38.32 
 
 		 828 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  35.56 
 
 		 802 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  36.56 
 
 		 802 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  36.56 
 
 		 802 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  35.64 
 
 		 804 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  35.24 
 
 		 809 aa  485  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  35.73 
 
 		 801 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  34.55 
 
 		 781 aa  477  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  34.9 
 
 		 798 aa  476  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  35.46 
 
 		 801 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  35.04 
 
 		 801 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  34.96 
 
 		 801 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  35.25 
 
 		 801 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  35.59 
 
 		 801 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  34.96 
 
 		 801 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  35.08 
 
 		 801 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  34.03 
 
 		 803 aa  466  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  35.25 
 
 		 801 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  34.87 
 
 		 801 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  35.04 
 
 		 801 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  33.45 
 
 		 811 aa  466  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  36.16 
 
 		 801 aa  459  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  33.93 
 
 		 798 aa  456  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  35.58 
 
 		 810 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  34.64 
 
 		 818 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  33.97 
 
 		 813 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  34.01 
 
 		 815 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  34.93 
 
 		 815 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  35.08 
 
 		 815 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  32.96 
 
 		 796 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  34.51 
 
 		 914 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  39.13 
 
 		 732 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  33.03 
 
 		 812 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  35.17 
 
 		 810 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  35.46 
 
 		 815 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  34.05 
 
 		 815 aa  425  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  34.82 
 
 		 825 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  34.38 
 
 		 802 aa  426  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  35.49 
 
 		 835 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  36.55 
 
 		 731 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  40.62 
 
 		 803 aa  420  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  38.08 
 
 		 745 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  34.77 
 
 		 843 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  33.17 
 
 		 835 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  36.7 
 
 		 731 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  34.35 
 
 		 812 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  34.87 
 
 		 810 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  40.71 
 
 		 738 aa  407  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  33.87 
 
 		 858 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  40.82 
 
 		 775 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  32.79 
 
 		 790 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  38.02 
 
 		 747 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  37.93 
 
 		 745 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  41.76 
 
 		 739 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  32.8 
 
 		 848 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  41.37 
 
 		 739 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  33.33 
 
 		 805 aa  402  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  40.66 
 
 		 749 aa  399  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  39.11 
 
 		 724 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  34.91 
 
 		 868 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  40.19 
 
 		 661 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  33.74 
 
 		 814 aa  399  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  40.26 
 
 		 758 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  36.36 
 
 		 752 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  32.37 
 
 		 821 aa  396  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  33.18 
 
 		 866 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  33.17 
 
 		 829 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  36.36 
 
 		 752 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  43.84 
 
 		 770 aa  391  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  37.15 
 
 		 732 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2032  primosomal protein N'  32.42 
 
 		 837 aa  389  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000296827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  39.31 
 
 		 754 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  33.83 
 
 		 849 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  40.39 
 
 		 744 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  41.3 
 
 		 836 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  38.8 
 
 		 739 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  41.5 
 
 		 780 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  41.75 
 
 		 744 aa  386  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  36.6 
 
 		 725 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  38.86 
 
 		 746 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  35.68 
 
 		 725 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  36.47 
 
 		 739 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  35.68 
 
 		 725 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  38.08 
 
 		 738 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  39.92 
 
 		 739 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  38.35 
 
 		 738 aa  382  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  39.88 
 
 		 733 aa  379  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  38.66 
 
 		 768 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  37.71 
 
 		 732 aa  379  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  36.68 
 
 		 735 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  42.95 
 
 		 774 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>