More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2035 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  42.95 
 
 		 831 aa  710    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 817 aa  1695    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  51.72 
 
 		 815 aa  903    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  51.91 
 
 		 815 aa  900    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  40.68 
 
 		 815 aa  636    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  41.92 
 
 		 824 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  43.62 
 
 		 804 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  41.33 
 
 		 832 aa  664    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  43.01 
 
 		 815 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  34.67 
 
 		 828 aa  499  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  35.27 
 
 		 804 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  35.15 
 
 		 802 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  34.6 
 
 		 801 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  34.72 
 
 		 801 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  34.34 
 
 		 801 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  34.34 
 
 		 801 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  34.34 
 
 		 801 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  34.34 
 
 		 801 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  34.85 
 
 		 801 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  34.34 
 
 		 801 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  33.96 
 
 		 801 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  34.6 
 
 		 801 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  34.6 
 
 		 801 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  34.01 
 
 		 801 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  34.97 
 
 		 802 aa  439  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  34.97 
 
 		 802 aa  439  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  33.84 
 
 		 796 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  34.96 
 
 		 781 aa  436  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  34.37 
 
 		 798 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  33.99 
 
 		 815 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  32.71 
 
 		 813 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_002950  PG2032  primosomal protein N'  33.78 
 
 		 837 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000296827 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  31.72 
 
 		 812 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  34.07 
 
 		 809 aa  429  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  32.74 
 
 		 752 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  33.2 
 
 		 815 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  32.44 
 
 		 810 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.31 
 
 		 745 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  32.99 
 
 		 754 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  33.52 
 
 		 811 aa  425  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  33.89 
 
 		 810 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  33.49 
 
 		 914 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  33.04 
 
 		 803 aa  418  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  31.94 
 
 		 803 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  33.25 
 
 		 798 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  34.23 
 
 		 749 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  31.33 
 
 		 746 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  33.12 
 
 		 814 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  31.51 
 
 		 810 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  33.21 
 
 		 758 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  34.39 
 
 		 812 aa  405  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  31.03 
 
 		 751 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  37.25 
 
 		 738 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  31.33 
 
 		 752 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  33.74 
 
 		 849 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  34.59 
 
 		 805 aa  402  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  39.93 
 
 		 732 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  32.87 
 
 		 802 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  33.46 
 
 		 836 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  31.66 
 
 		 835 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  37.31 
 
 		 732 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  31.68 
 
 		 815 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  35.1 
 
 		 745 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  31.28 
 
 		 843 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  36.99 
 
 		 732 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  33.38 
 
 		 821 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  33.8 
 
 		 775 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  37.21 
 
 		 733 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  31.47 
 
 		 825 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  39.84 
 
 		 661 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  32.27 
 
 		 818 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  31.59 
 
 		 815 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  34.7 
 
 		 731 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  37.63 
 
 		 733 aa  389  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  34.43 
 
 		 732 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  35.53 
 
 		 733 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  35.19 
 
 		 732 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  31.69 
 
 		 732 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  31.69 
 
 		 732 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  31.32 
 
 		 848 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  37.46 
 
 		 733 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  37.06 
 
 		 747 aa  386  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  37.48 
 
 		 730 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  38.7 
 
 		 679 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  37.13 
 
 		 738 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  35.02 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  35.02 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  35.02 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  35.02 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  37.83 
 
 		 735 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  33.15 
 
 		 732 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  35.02 
 
 		 732 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  34.43 
 
 		 732 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  34.43 
 
 		 732 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  34.43 
 
 		 732 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  35.02 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  34.86 
 
 		 732 aa  382  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  31.97 
 
 		 731 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  35.02 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  38.14 
 
 		 746 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>