28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  769    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06610  hypothetical protein  36.64 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  35.61 
 
 
505 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  31.03 
 
 
265 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22500  hypothetical protein  45.9 
 
 
166 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.682327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  33.82 
 
 
526 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  34.21 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  31.97 
 
 
514 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0271  FHA domain containing protein  41.38 
 
 
239 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.373949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  28.45 
 
 
376 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16420  F5/8 type C domain-containing protein  41.54 
 
 
322 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.504791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4395  hypothetical protein  33.8 
 
 
93 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  38.46 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  31.67 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2122  hypothetical protein  34.13 
 
 
181 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.235072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  28.95 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  37.7 
 
 
299 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  34 
 
 
433 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2212  hypothetical protein  32.8 
 
 
180 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.666901  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  38.71 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.18 
 
 
356 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4556  protein serine/threonine phosphatase  37.88 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.614538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.14 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  34.78 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1100  hypothetical protein  36.67 
 
 
131 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000487514  hitchhiker  0.0000000000000158155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  39.44 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2185  hypothetical protein  37.1 
 
 
214 aa  43.1  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.1 
 
 
1149 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>