19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16420  F5/8 type C domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  660    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.504791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05810  activator of osmoprotectant transporter ProP  46.26 
 
 		 286 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2449  hypothetical protein  29.46 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 1093 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 1148 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04540  sporulation related protein  30.71 
 
 		 272 aa  53.1  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000449317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06650  hypothetical protein  40.32 
 
 		 402 aa  49.3  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22480  hypothetical protein  29.01 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.606654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36 
 
 		 1149 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  36.59 
 
 		 514 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 		 505 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  37.1 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22530  hypothetical protein  32.95 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2148  hypothetical protein  26.87 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 1151 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  28.57 
 
 		 794 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  30 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22500  hypothetical protein  35.59 
 
 		 166 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.682327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6771  hypothetical protein  31.71 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>