27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2148 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2148  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  902    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2426  TcaA protein  28.41 
 
 		 460 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2380  membrane protein-like protein  28.41 
 
 		 460 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1948  tcaA protein  29.28 
 
 		 462 aa  133  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2420  hypothetical protein  67.5 
 
 		 81 aa  101  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0413181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2161  putative lipoprotein  73.53 
 
 		 292 aa  99.8  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2742  membrane protein-like protein  27.65 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.56545  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2819  hypothetical protein  27.65 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  25.52 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  24.18 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5366  hypothetical protein  23.81 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  23.28 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  24.11 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4922  hypothetical protein  22.99 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5414  hypothetical protein  23.58 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5092  hypothetical protein  23.15 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5483  hypothetical protein  23.15 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5362  hypothetical protein  23.21 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0019  hypothetical protein  27.38 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  20.13 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0715  hypothetical protein  20.7 
 
 		 516 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  20.6 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  18.22 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  23.72 
 
 		 794 aa  47.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04540  sporulation related protein  30 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000449317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22530  hypothetical protein  53.57 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5207  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>