22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1948 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1948  tcaA protein  100 
 
 		 462 aa  939    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2426  TcaA protein  58.44 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2380  membrane protein-like protein  58.44 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2148  hypothetical protein  30.05 
 
 		 443 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2742  membrane protein-like protein  27.03 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.56545  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2819  hypothetical protein  27.03 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0019  hypothetical protein  27.2 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  26.06 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  20.77 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02160  hypothetical protein  28.18 
 
 		 272 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5414  hypothetical protein  23.83 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  24.69 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4922  hypothetical protein  23.47 
 
 		 459 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  24.69 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  21.28 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0715  hypothetical protein  24.22 
 
 		 516 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  19.48 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5483  hypothetical protein  22.78 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5092  hypothetical protein  22.78 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  21.67 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5366  hypothetical protein  23.02 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  56.52 
 
 		 352 aa  43.5  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>