18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22530  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  798    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  29.95 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  42.55 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  44.83 
 
 
411 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0112  hypothetical protein  43.18 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00718309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0114  hypothetical protein  43.18 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1700  Serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 
496 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0154574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  37.08 
 
 
449 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04540  sporulation related protein  34.35 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000449317 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2135  hypothetical protein  40 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16420  F5/8 type C domain-containing protein  33.71 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.504791 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2161  hypothetical protein  48.78 
 
 
353 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06660  hypothetical protein  51.16 
 
 
386 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100773  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22480  hypothetical protein  33.08 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.606654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1330  IG hypothetical 16680  46.51 
 
 
64 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000323486 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  30.43 
 
 
794 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1408  IG hypothetical 16680  44.19 
 
 
64 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2148  hypothetical protein  41.67 
 
 
443 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>