14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01220 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  884    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23540  hypothetical protein  68.75 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  hitchhiker  0.00287708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02170  hypothetical protein  45.45 
 
 		 270 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02160  hypothetical protein  35.62 
 
 		 272 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04540  sporulation related protein  28.33 
 
 		 272 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000449317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.02 
 
 		 341 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26200  hypothetical protein  44.68 
 
 		 312 aa  47  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.987392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0122  hypothetical protein  27.12 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.979419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  22.96 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 107 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21970  hypothetical protein  35.29 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000547844  hitchhiker  0.00670198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  34.21 
 
 		 794 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0501  hypothetical protein  28.26 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000761016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  33.78 
 
 		 107 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>