13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02160  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02170  hypothetical protein  64.47 
 
 		 270 aa  328  7e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23540  hypothetical protein  69.23 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  hitchhiker  0.00287708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  39.73 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26200  hypothetical protein  30.95 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.987392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27130  hypothetical protein  75 
 
 		 174 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.823012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  36.36 
 
 		 794 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1948  tcaA protein  26.15 
 
 		 462 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0823  hypothetical protein  53.85 
 
 		 482 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0292128  normal  0.928575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0512  hypothetical protein  52.78 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1432  hypothetical protein  44.12 
 
 		 529 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.177306  decreased coverage  0.000115076 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21970  hypothetical protein  48.39 
 
 		 400 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000547844  hitchhiker  0.00670198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22480  hypothetical protein  39.58 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.606654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>