14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02170  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02160  hypothetical protein  65.2 
 
 		 272 aa  348  7e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  43.28 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23540  hypothetical protein  72.22 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  hitchhiker  0.00287708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26200  hypothetical protein  30.37 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.987392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  40.54 
 
 		 794 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27130  hypothetical protein  57.78 
 
 		 174 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.823012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1948  tcaA protein  28 
 
 		 462 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  41.67 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2148  hypothetical protein  28.28 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1432  hypothetical protein  48.48 
 
 		 529 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.177306  decreased coverage  0.000115076 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06660  hypothetical protein  48.89 
 
 		 386 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3655  hypothetical protein  30.86 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0574  hypothetical protein  51.85 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>