22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_27130  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.823012  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  50 
 
 
1291 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02160  hypothetical protein  75 
 
 
272 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23540  hypothetical protein  62.86 
 
 
264 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  hitchhiker  0.00287708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  45.95 
 
 
432 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02170  hypothetical protein  70.83 
 
 
270 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26200  hypothetical protein  44.23 
 
 
312 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.987392  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2271  hypothetical protein  37.84 
 
 
431 aa  45.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.172675  hitchhiker  0.000642558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  26.03 
 
 
210 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0271  FHA domain containing protein  47.92 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.373949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0512  hypothetical protein  52.63 
 
 
289 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  56.67 
 
 
457 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06660  hypothetical protein  38.71 
 
 
386 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100773  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1146  hypothetical protein  37.84 
 
 
325 aa  43.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  44.23 
 
 
1148 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  26.85 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  42.86 
 
 
262 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  53.33 
 
 
177 aa  42  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.25 
 
 
1141 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1304  hypothetical protein  29.17 
 
 
261 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  45.45 
 
 
1151 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13900  hypothetical protein  44.19 
 
 
181 aa  41.2  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>