69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0698 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  43.26 
 
 
249 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  43.12 
 
 
172 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  40.65 
 
 
442 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  45.71 
 
 
113 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  91.7  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  26.7 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  38.6 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  38.66 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  38.66 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  41.74 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  42.24 
 
 
122 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  36.57 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  39.81 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  34.82 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  33.1 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  33.94 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  35.4 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  35.4 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  30.7 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  30.7 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  33.63 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  37.72 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1370  hypothetical protein  31.91 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  41.03 
 
 
122 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  33.04 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  30.83 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  31.61 
 
 
179 aa  62  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  32.46 
 
 
122 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  36.14 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  31.53 
 
 
118 aa  58.9  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  37.23 
 
 
118 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  33.62 
 
 
122 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  28.57 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  37.8 
 
 
118 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  37.8 
 
 
118 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  37.8 
 
 
118 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  37.8 
 
 
118 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  36.19 
 
 
125 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1372  hypothetical protein  29.36 
 
 
120 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  30.09 
 
 
113 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  36.26 
 
 
103 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  32.53 
 
 
106 aa  51.6  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  31.87 
 
 
119 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2133  hypothetical protein  30.22 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.670614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2213  hypothetical protein  34.58 
 
 
125 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550536  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3258  hypothetical protein  29.41 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00267617  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  35.96 
 
 
1821 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  39.33 
 
 
196 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  32.43 
 
 
139 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  27.08 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  47.52 
 
 
479 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  24.32 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  34.23 
 
 
1079 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  29.67 
 
 
149 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0029  FHA domain-containing protein  45.24 
 
 
470 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  30.16 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  46.39 
 
 
428 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  34.95 
 
 
1029 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  32.84 
 
 
180 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1827  hypothetical protein  32.04 
 
 
114 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.447916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>