26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1887 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  534  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2988  fimbrial protein pilin  50.77 
 
 
163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  43.75 
 
 
254 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1569  pilin, type IV, putative  51.59 
 
 
162 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467783  hitchhiker  0.00664496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3772  hypothetical protein  50.79 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.17734  normal  0.182511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1570  pilin, type IV, putative  48.8 
 
 
162 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0025614  normal  0.0450256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1602  pilin, type IV, putative  44.19 
 
 
187 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1886  hypothetical protein  39.72 
 
 
153 aa  95.9  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0363859  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0370  hypothetical protein  50.63 
 
 
124 aa  86.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.15539e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  42.11 
 
 
186 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3610  hypothetical protein  36.84 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.166394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3697  Interferon-induced transmembrane protein  60 
 
 
92 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3231  hypothetical protein  35.38 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.771885  decreased coverage  0.007242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3696  Interferon-induced transmembrane protein  51.56 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247203  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4141  hypothetical protein  34.44 
 
 
194 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0294  interferon-induced transmembrane protein  48 
 
 
188 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6517  interferon-induced transmembrane protein  50.94 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118232  normal  0.093626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6424  Interferon-induced transmembrane protein  38.37 
 
 
114 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2225  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000144782  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0295  heat shock protein DnaJ-like  36.36 
 
 
384 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2010  hypothetical protein  43.94 
 
 
115 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4718  hypothetical protein  63.64 
 
 
122 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0066  hypothetical protein  34.12 
 
 
103 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3176  Interferon-induced transmembrane protein  38.55 
 
 
109 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335439  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1162  hypothetical protein  40.96 
 
 
136 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3178  Interferon-induced transmembrane protein  38.46 
 
 
131 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>