293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3772 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3772  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.17734  normal  0.182511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1569  pilin, type IV, putative  95.68 
 
 		 162 aa  276  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467783  hitchhiker  0.00664496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1570  pilin, type IV, putative  95.68 
 
 		 162 aa  244  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0025614  normal  0.0450256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2988  fimbrial protein pilin  80.98 
 
 		 163 aa  228  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1602  pilin, type IV, putative  61.99 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  59.33 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  48.37 
 
 		 262 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  46.43 
 
 		 254 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4141  hypothetical protein  40.12 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3231  hypothetical protein  40.3 
 
 		 302 aa  87.8  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.771885  decreased coverage  0.007242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3610  hypothetical protein  38.4 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.166394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2225  hypothetical protein  35.43 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000144782  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.44 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.06 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  55.77 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  36.05 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  51.85 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  39.22 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  41.77 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  41.77 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  40.38 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  43.55 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  45.16 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  31.71 
 
 		 146 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  32.93 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  36.9 
 
 		 118 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  28.67 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.06 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  35.94 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.11 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.51 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  48.44 
 
 		 111 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  38.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.9 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.09 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  45.28 
 
 		 70 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  32.99 
 
 		 325 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  37.27 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  39.34 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  30.16 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  34.52 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  52.17 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  35.94 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 		 313 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  36.73 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  36.73 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  46.43 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  38.03 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  36.73 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  64.71 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  36.73 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  31.33 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  35 
 
 		 323 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  35 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  29.33 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  65.62 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  35.09 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  30.77 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  55.1 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  30.77 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  60.61 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.44 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1177  methylation  41.35 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  33.77 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  42.37 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  46.03 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  42.31 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  51.28 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  38.46 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  38.46 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>