28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1888 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  36.06 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2988  fimbrial protein pilin  50 
 
 
163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1569  pilin, type IV, putative  47.14 
 
 
162 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467783  hitchhiker  0.00664496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3772  hypothetical protein  45.71 
 
 
181 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.17734  normal  0.182511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1602  pilin, type IV, putative  46.76 
 
 
187 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1570  pilin, type IV, putative  44.29 
 
 
162 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0025614  normal  0.0450256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  49.26 
 
 
186 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3610  hypothetical protein  29.02 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.166394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4141  hypothetical protein  37.8 
 
 
194 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3231  hypothetical protein  35.71 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.771885  decreased coverage  0.007242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  42.05 
 
 
105 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  43.59 
 
 
129 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  35.11 
 
 
133 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1253  hypothetical protein  31.29 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  40.26 
 
 
144 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2225  hypothetical protein  30.19 
 
 
233 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000144782  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2859  hypothetical protein  42.39 
 
 
146 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2299  hypothetical protein  35.79 
 
 
126 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.233786  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  41.57 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  47.95 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  41.79 
 
 
95 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  43.33 
 
 
94 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  33.33 
 
 
484 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01220  hypothetical protein  40.91 
 
 
432 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  37.36 
 
 
137 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2057  hypothetical protein  42.25 
 
 
97 aa  42  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>