33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4141 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4141  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1569  pilin, type IV, putative  41.14 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467783  hitchhiker  0.00664496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3772  hypothetical protein  40.37 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.17734  normal  0.182511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  40.69 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2988  fimbrial protein pilin  39.75 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1602  pilin, type IV, putative  43.17 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1570  pilin, type IV, putative  40.51 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0025614  normal  0.0450256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  34.44 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  35.9 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  31.54 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  33.02 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.79 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  39.62 
 
 
115 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  35.48 
 
 
70 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  32.76 
 
 
323 aa  44.7  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  37.1 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  31.58 
 
 
142 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  26.47 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  36.36 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  28.77 
 
 
338 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.73 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  29.82 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  39.29 
 
 
118 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  30.43 
 
 
130 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  29.09 
 
 
153 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.1 
 
 
173 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  36.25 
 
 
207 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  42.5 
 
 
131 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 
146 aa  41.2  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  34.25 
 
 
176 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 
157 aa  41.2  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  34.25 
 
 
176 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>