198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2988 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2988  fimbrial protein pilin  100 
 
 
163 aa  323  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1569  pilin, type IV, putative  80.98 
 
 
162 aa  231  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467783  hitchhiker  0.00664496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3772  hypothetical protein  80.98 
 
 
181 aa  231  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.17734  normal  0.182511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1570  pilin, type IV, putative  80.98 
 
 
162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0025614  normal  0.0450256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  60.26 
 
 
186 aa  160  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1602  pilin, type IV, putative  59.51 
 
 
187 aa  154  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  51.05 
 
 
262 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  49.61 
 
 
254 aa  121  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4141  hypothetical protein  39.75 
 
 
194 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3231  hypothetical protein  37.4 
 
 
302 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.771885  decreased coverage  0.007242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2225  hypothetical protein  35.43 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000144782  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3610  hypothetical protein  35.9 
 
 
315 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.166394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  57.69 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40.85 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40.85 
 
 
142 aa  57.4  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  45.07 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  45.07 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  43.24 
 
 
187 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  35.8 
 
 
188 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  42.25 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  42.25 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  42.37 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  33.75 
 
 
325 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  49.09 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  49.09 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.17 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.9 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  48.21 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  44.07 
 
 
158 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  51.02 
 
 
70 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.94 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  46.77 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  36.14 
 
 
187 aa  47  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  38.6 
 
 
323 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  36.21 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  38.57 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  39.02 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  36.67 
 
 
313 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  40.32 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  75 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  44.23 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  36.99 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  30.91 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  35.53 
 
 
324 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  50 
 
 
139 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  37.29 
 
 
326 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  71.43 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  40.38 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  45.83 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  35 
 
 
330 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  29.11 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  52.5 
 
 
567 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  46.03 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  46.15 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 
163 aa  44.3  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  34.48 
 
 
338 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  34.48 
 
 
321 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  47.27 
 
 
141 aa  44.3  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 
144 aa  44.3  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  38.1 
 
 
141 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  30.65 
 
 
144 aa  43.9  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  31.75 
 
 
208 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  40 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.57 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  27.42 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  34.38 
 
 
349 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  38.46 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  27.87 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 
353 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.35 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.97 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  44.83 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  40 
 
 
124 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  27.42 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  76 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.57 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  30.16 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  40.35 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  30.36 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  38.46 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  30.36 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  30.16 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.9 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>