More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1602 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1602  pilin, type IV, putative  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3772  hypothetical protein  61.99 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.17734  normal  0.182511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1569  pilin, type IV, putative  62.96 
 
 		 162 aa  171  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467783  hitchhiker  0.00664496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1570  pilin, type IV, putative  62.35 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0025614  normal  0.0450256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  56.38 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2988  fimbrial protein pilin  59.51 
 
 		 163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  42.59 
 
 		 262 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  46.76 
 
 		 254 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4141  hypothetical protein  42.25 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3231  hypothetical protein  30.77 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.771885  decreased coverage  0.007242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  40.91 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  48.68 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.54 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  53.7 
 
 		 115 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  31.75 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50.82 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50.82 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2225  hypothetical protein  29.92 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000144782  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  43.42 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  42.11 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.61 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  41.1 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  36.51 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.55 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  26.76 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 144 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3610  hypothetical protein  29.36 
 
 		 315 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.166394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  30.38 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  31.4 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  31.4 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 		 323 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  38.46 
 
 		 140 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  38.46 
 
 		 140 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  35.05 
 
 		 118 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  46.3 
 
 		 70 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.17 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  30.11 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  46.03 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.78 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  47.76 
 
 		 111 aa  48.9  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  31.65 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  43.86 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  46.15 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46 
 
 		 151 aa  47.8  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  30.23 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  33.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.68 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  33.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  46.03 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  28.7 
 
 		 121 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  30.94 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  30.88 
 
 		 353 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.46 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  33.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.72 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  31.58 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1177  methylation  48.1 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  34 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>