45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4437 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  974    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  44.74 
 
 		 129 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0722  hypothetical protein  28.5 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  38.6 
 
 		 184 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  40.98 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  39.8 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  39.34 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  40.68 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  38.41 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2457  hypothetical protein  23.7 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1061  hypothetical protein  25.78 
 
 		 174 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0479  hypothetical protein  31.62 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  44.3 
 
 		 236 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  53.5  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0480  hypothetical protein  29.57 
 
 		 198 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2084  hypothetical protein  29.06 
 
 		 189 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3649  hypothetical protein  25.87 
 
 		 289 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  30.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  36.44 
 
 		 174 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  30.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  30.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3422  hypothetical protein  27.34 
 
 		 150 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0478  hypothetical protein  26.13 
 
 		 163 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.695853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  34.21 
 
 		 249 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0183  hypothetical protein  23.51 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3650  hypothetical protein  29.87 
 
 		 286 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  46.58 
 
 		 219 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  40.62 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  40.62 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  40.62 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  41.11 
 
 		 178 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  35.44 
 
 		 144 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  38.14 
 
 		 133 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3015  hypothetical protein  23.19 
 
 		 179 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.430528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0271  hypothetical protein  32.12 
 
 		 190 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2227  hypothetical protein  36.31 
 
 		 322 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  32.43 
 
 		 104 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01100  hypothetical protein  35.59 
 
 		 189 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1337  hypothetical protein  32.22 
 
 		 266 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  35.53 
 
 		 94 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3739  hypothetical protein  26.06 
 
 		 253 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3478  hypothetical protein  30.12 
 
 		 241 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>