31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1709 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  30.84 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  34.01 
 
 		 181 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  39.18 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  38.37 
 
 		 168 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  30.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  34.72 
 
 		 160 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  36.26 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  30.3 
 
 		 484 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  34.57 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  31.76 
 
 		 137 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  34.57 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  33.77 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  29.55 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  32.5 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  39.47 
 
 		 133 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  28.05 
 
 		 174 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0301  hypothetical protein  30.38 
 
 		 125 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.11 
 
 		 438 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  31.18 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0271  hypothetical protein  34.65 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  28.95 
 
 		 179 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  31.88 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  31.88 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  31.88 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  34.94 
 
 		 162 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>