23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11258 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  56.32 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  43.66 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  46.15 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  46.15 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  38.74 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  39.57 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  46.67 
 
 
129 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  44.29 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  34.09 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  35.77 
 
 
160 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  36.84 
 
 
162 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  34.85 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  37.14 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  34.34 
 
 
236 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  40.28 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  28.85 
 
 
174 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  58.06 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  58.06 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  58.06 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  33.78 
 
 
282 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  32.84 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2686  hypothetical protein  31.52 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>