29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3985 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  90.81 
 
 
179 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  56.18 
 
 
218 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  45.57 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  35.04 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  43.75 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  42.22 
 
 
228 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  37.88 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  41.84 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  43.59 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  41.33 
 
 
129 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  42.62 
 
 
162 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  49.06 
 
 
282 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  35.29 
 
 
249 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  34.82 
 
 
236 aa  48.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  31.11 
 
 
133 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  31.51 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  39.32 
 
 
521 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 
594 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  37.18 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  33.9 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  42.86 
 
 
320 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  42.86 
 
 
320 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0847  hypothetical protein  26.53 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0948898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  42.86 
 
 
320 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8090  hypothetical protein  41.51 
 
 
370 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  26.51 
 
 
209 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  34.3 
 
 
163 aa  41.2  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>