36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2703 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  302  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  39.83 
 
 
236 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  40 
 
 
521 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  49.28 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  40.78 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  35.14 
 
 
249 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  41.1 
 
 
484 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  36.78 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  40.95 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  41.56 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  35 
 
 
209 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  42.37 
 
 
235 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  38.2 
 
 
228 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  35.59 
 
 
181 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  35.23 
 
 
218 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  45.45 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  41.56 
 
 
95 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  41.1 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  41.1 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  40.79 
 
 
133 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  33.98 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2686  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  37.5 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  34.26 
 
 
174 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3128  hypothetical protein  41.77 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.499984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2652  hypothetical protein  38.64 
 
 
924 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  36.14 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  38.14 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0271  hypothetical protein  36.43 
 
 
190 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  37.97 
 
 
219 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  39.71 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8906  hypothetical protein  31.82 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  26.37 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4217  hypothetical protein  33.02 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.527647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  30.83 
 
 
172 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>