34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5700 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2223  hypothetical protein  53.73 
 
 
175 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  43.53 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  39.53 
 
 
161 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  43.04 
 
 
129 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  40.79 
 
 
168 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  30.06 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  51.52 
 
 
172 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.25 
 
 
2179 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  42.47 
 
 
205 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.61 
 
 
2449 aa  52  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  28.81 
 
 
2272 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  36.22 
 
 
484 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  31.86 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  35.37 
 
 
137 aa  50.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  32.84 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  33.33 
 
 
3409 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  36.79 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  40.74 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3056  hypothetical protein  47.27 
 
 
200 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  32.18 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3099  hypothetical protein  47.27 
 
 
200 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0223818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3040  hypothetical protein  47.27 
 
 
200 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  32.47 
 
 
144 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2591  hypothetical protein  39.68 
 
 
138 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000331884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  28.42 
 
 
3472 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  31.65 
 
 
3521 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  28.42 
 
 
3471 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2686  hypothetical protein  36.11 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  28.65 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.87 
 
 
1888 aa  42.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.94 
 
 
438 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>