33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3040 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3040  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3099  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0223818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3056  hypothetical protein  99.5 
 
 		 200 aa  386  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  52.32 
 
 		 172 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  56.74 
 
 		 165 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  42.39 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  39.29 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  38 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  35.61 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  44.44 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  34.81 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  30.45 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.29 
 
 		 438 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  39.05 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  36.5 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  38.74 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  29.67 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2574  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0029  hypothetical protein  31.47 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0564693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  32.67 
 
 		 104 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2686  hypothetical protein  32.03 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  40.7 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  36.26 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  37.4 
 
 		 521 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0242  hypothetical protein  32.73 
 
 		 339 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  31.15 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  31.2 
 
 		 484 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01690  hypothetical protein  34.02 
 
 		 323 aa  42  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000277676  decreased coverage  0.0000000000000177257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  37.59 
 
 		 163 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>