47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2969 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  323  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.91 
 
 		 438 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  46.48 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  35.37 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  40.79 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  35.76 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  26.49 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  39.47 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  36.9 
 
 		 198 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01100  hypothetical protein  35.88 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  29.93 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  35.25 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4199  hypothetical protein  45.31 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112437  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  29.84 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  29.06 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  34.12 
 
 		 129 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  34.55 
 
 		 218 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2686  hypothetical protein  29.51 
 
 		 200 aa  47.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  32.1 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3033  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000104497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  28.32 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6424  Interferon-induced transmembrane protein  35.16 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 484 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  34.62 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0726  hypothetical protein  41.1 
 
 		 109 aa  44.3  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0166785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6722  hypothetical protein  31.25 
 
 		 259 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1337  hypothetical protein  30.43 
 
 		 266 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  31.29 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  35.24 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  35.24 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  33.87 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  40.52 
 
 		 514 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3040  hypothetical protein  36.14 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3099  hypothetical protein  36.14 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0223818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  27.2 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3056  hypothetical protein  36.14 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  32.93 
 
 		 2179 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  67.35 
 
 		 428 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  27.61 
 
 		 160 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0301  hypothetical protein  29.35 
 
 		 125 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  56.52 
 
 		 405 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>