48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3746 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  100 
 
 		 514 aa  997    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  38.37 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  35.59 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  31.62 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  34.36 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  34.32 
 
 		 384 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  33.24 
 
 		 370 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  35.63 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  32.21 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  33.95 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  33.95 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  33.95 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  31.4 
 
 		 362 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  30.37 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  29.92 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  30.29 
 
 		 414 aa  118  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  32.92 
 
 		 331 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  32.14 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  31.39 
 
 		 335 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  32.1 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  29.76 
 
 		 294 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  31.82 
 
 		 390 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  28.31 
 
 		 375 aa  93.2  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  30.09 
 
 		 336 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  27.67 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  31.65 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000386077  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  29.13 
 
 		 1116 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0153  hypothetical protein  41.67 
 
 		 784 aa  53.5  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  39.57 
 
 		 323 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  29.11 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  47.32 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  26.33 
 
 		 348 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  32.88 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1469  hypothetical protein  39.39 
 
 		 240 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000606848  normal  0.0260491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  53.62 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  41.14 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0031  Forkhead-associated protein  68.75 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  40.77 
 
 		 830 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  30.08 
 
 		 3242 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.54 
 
 		 751 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3671  hypothetical protein  24.32 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  49 
 
 		 334 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1279  hypothetical protein  41.18 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147565  normal  0.302558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  31.03 
 
 		 285 aa  43.9  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8250  hypothetical protein  36.89 
 
 		 390 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4422  hypothetical protein  30.95 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>