45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8022 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  805    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  43.4 
 
 		 162 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  40.97 
 
 		 173 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  40.28 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  36.69 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  37.41 
 
 		 165 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  33.56 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  36.76 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  33.11 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  37.41 
 
 		 186 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  34.53 
 
 		 170 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  35.86 
 
 		 168 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  41.67 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  34.35 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  33.96 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  35.24 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  33.07 
 
 		 148 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  26.12 
 
 		 154 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  25.9 
 
 		 145 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  26.24 
 
 		 153 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  34.33 
 
 		 250 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  29.5 
 
 		 152 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  32.24 
 
 		 152 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  24.68 
 
 		 222 aa  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.58 
 
 		 177 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.17 
 
 		 152 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  30.19 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  32.73 
 
 		 245 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  32.73 
 
 		 245 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  32.73 
 
 		 245 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  29.25 
 
 		 245 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  29.25 
 
 		 245 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  27.87 
 
 		 146 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  27.59 
 
 		 179 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  45.16 
 
 		 263 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  30.37 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  25.18 
 
 		 177 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  44.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  32.48 
 
 		 125 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  28.69 
 
 		 176 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  25.19 
 
 		 162 aa  43.5  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  30.23 
 
 		 339 aa  43.1  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.314555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>