23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4486 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  43.62 
 
 
235 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  56.1 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  44.95 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  36.26 
 
 
178 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  41.9 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  38.06 
 
 
249 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  34.09 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  34.46 
 
 
160 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  44.83 
 
 
162 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  33.88 
 
 
484 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  38.21 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  41.07 
 
 
521 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  42.25 
 
 
129 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.54 
 
 
320 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.54 
 
 
320 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.54 
 
 
320 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  40.26 
 
 
137 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  36.84 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  43.42 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2227  hypothetical protein  39.83 
 
 
322 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  43.48 
 
 
104 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>