31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1385 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  521  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  41.41 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  49.48 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  46.39 
 
 		 133 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  37.93 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  44.21 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  47.25 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  44.87 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  39.66 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  45.95 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  45.21 
 
 		 185 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  37.18 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  45.21 
 
 		 185 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  44.71 
 
 		 104 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2652  hypothetical protein  38.04 
 
 		 924 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  38.36 
 
 		 184 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  40.35 
 
 		 160 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  37.62 
 
 		 178 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  34.97 
 
 		 163 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  41.25 
 
 		 102 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  38.76 
 
 		 1821 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0271  hypothetical protein  31.35 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  40.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  35.77 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.06 
 
 		 2179 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  30.69 
 
 		 985 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  36.84 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  36.84 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  36.84 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  31.96 
 
 		 521 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>